基于TCGA数据库的前列腺癌组织免疫细胞浸润模式预测

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目的研究前列腺癌组织中免疫细胞的浸润模式及其与临床预后之间的相关性。方法TCGA数据库下载前列腺癌mRNA表达数据及临床资料,通过CIBERSORT软件预测前列腺癌组织中22种免疫细胞的浸润模式,应用R语言分析各种免疫细胞与生存的相关性。结果TCGA数据库共下载mRNA表达数据540例,包含前列腺癌组织490例,正常前列腺组织50例,共检测mRNA 60483个,对所得矩阵文件校正后,应用CIBERSORT软件的反卷积法预测22种免疫细胞的构成比。结果显示,前列腺癌组织中未活化的CD4记忆性T细胞(24.
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