基于TCGA数据库乳腺癌lncRNA的分析研究

来源 :包头医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:seryhugjkghj
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目的:通过分析癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中乳腺癌和癌旁组织的lncRNA,研究lncRNA对乳腺癌发生发展的影响。方法:从TCGA数据库中下载乳腺癌lncRNA表达RNAseq数据,对乳腺癌患者的lncRNA进行差异表达分析,对得出的差异表达lncRNA进一步行生存分析,得到与乳腺癌有明显差异表达同时也对生存有相关性的lncRNA。另外,对mRNA、miRNA行差异表达分析,对得到的构建lncRNA-miRNA-mRNA相关ceRNA调控网,再对生存相
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