基于TCGA数据库的肺腺癌microRNAs分析性研究

来源 :内蒙古医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong539
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目的:肺癌是全世界导致人类死亡的主要原因,肺癌中肺腺癌最常见,随着社会的进步及医疗水平的快速发展,肺癌在诊断及治疗方面已取得很大成就,但是随着大气污染愈发严重,肺癌的发病率及死亡率也不断的上升,现有的生物标志物不能及时动态监测疾病的预后情况。探索肺癌的发病机制,寻找有效的肺癌筛查和早期诊断的生物标志物,是降低肺癌发病率和死亡率的关键。miRNAs(microRNAs,微小RNAs)是一类长度为19-24个核苷酸的小非编码RNA,可作为基因表达的转录后调节因子.,miRNAs在大多数细胞和发育过程中发挥着重要的调节作用,并参与了许多人类疾病的,尤其在肿瘤疾病。越来越多的研究发现,miRNAs有望成为新的肿瘤生物标志物,本研究目的在寻找肺腺癌特异性相关的miRNAs,为肺腺癌患者提供新的生物标志物。方法:(1)从TCGA(The Cancer Genome Atla,癌症基因组图谱)数据库中收集521个肺腺癌癌组织及46个癌旁正常组织miRNAs的数据,并进行癌组织及癌旁正常组织做差异性miRNA分析。(2)利用LASSO&COX进行与预后相关miRNA的筛选。(3)对筛选出来的miRNA进行COX多因素回归分析。(4)进行Kaplan-Meier生存曲线分析,明确与肺腺癌预后密切相关的miRNA。结果:(1)我们共筛选出298个差异性表达的miRNAs,其中有241个miRNAs高表达,57个miRNAs低表达。(2)我们再对298个差异性表达的miRNAs进行单因素COX回归分析,发现有41个差异表达的miRNAs与肺腺癌预后相关,其中有23个miRNAs在肺腺癌的表达提示高风险,有18个miRNAs在肺腺癌的表达提示低风险。(3)进一步对41个miRNAs进行LASSO&COX回归分析,最终筛选出24个与肺腺癌预后相关miRNAs。其中有14个miRNAs回归系数大于零,与患者生存时间呈负相关。10个miRNAs回归系数小于零,与患者生存时间呈正相关。(4)进行COX多因素分析发现,有3个(miR-548au、miR-1293、miR-543)的表达提示为肺腺癌预后不良的高风险预测因子。同时有4个(miR-548v、miR-490、miR-5571、miR-142)的提示为肺腺癌预后不良的低风险预测因子。(5)再进一步行Kaplan-Meier生存曲线分析,根据P值<0.05选出具有统计学的意义的miRNA。结果发现24个中有11个miRNAs有统计学意义,13个miRNA无统计学意义。且结果与上述分析结果基本一致。结论:(1)与癌旁正常组织相比miR-548au、miR-1293、miR-543对肺腺癌预后不良预测为高风险,miR-548v、miR-490、miR-5571、miR-142对肺腺癌预后不良预测为低风险。(2)与癌旁正常组织相比miR-1293miR-31,miR-4661,miR-550a-1,miR-873表达量与生存时间呈负相关。miR-142,miR-211,miR-328,miR-490,miR-548v,miR-5571表达量与生存时间呈正相关。
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