基于TCGA和Oncomine数据库前列腺癌关键基因的筛选

来源 :浙江医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：Mafei19881016

【摘要】

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目的利用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)和Oncomine数据库筛选前列腺癌(PCa)的关键基因。方法从TCGA数据库中下载PCa的RNA测序数据,包括PCa组织499例,癌旁正常组织52例。利用R软件

【作者】

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瞿根义向茂林徐勇阳光王佳威汤乘

【机构】

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中南大学湘雅医学院附属株洲医院泌尿外科

【出处】

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浙江医学

【发表日期】

：

2020年24期

【关键词】

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前列腺癌关键基因生物信息学 Prostate cancer Key genes Bioinformatics

【基金项目】

：

株洲市科技计划项目(2019-001)

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目的利用癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)和Oncomine数据库筛选前列腺癌(PCa)的关键基因。方法从TCGA数据库中下载PCa的RNA测序数据,包括PCa组织499例,癌旁正常组织52例。利用R软件筛选差异表达基因,采用DAVID、STRING数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用Cytoscape软件筛选PPI网络中连接程度前10位Hub基因,采用Oncomine数据库获取Hub基因与PCa相关数据,通过Meta分析获

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