基于TCGA数据库分析、筛选并验证前列腺癌诊断或预后标志物

来源 :天津医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:epslon003
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目的:综合分析表达谱数据与DNA甲基化数据,探索新的前列腺癌诊断或预后的标志物。方法:在TCGA公共数据库下载前列腺癌的甲基化水平数据以及mRNA表达数据;利用R软件中的DESeq2包对表达谱数据进行差异表达分析,利用R软件中的limma包对DNA甲基化芯片进行差异甲基化位点分析;采用美国国立卫生研究院的DAVID v6.7在线软件平台进行功能和通路的富集分析;对筛选出的基因进行Kaplan-Meier生存分析以及分子生物学实验验证。结果:差异表达分析得到1130个差异表达基因,其中759个表达下调,37
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