熊明遇不仅是明末清初具有一定影响力的天文、历法学家而且也是一位学养深厚的儒者。熊明遇在积极引入与学习西学的同时对中西方的天文历算进行了综合性研究，在分析考证西方科学知识优劣的同时不断省思中国传统科技知识，把西学的优秀部分融入到中国文化中来，为我国的科技发展做出了突出贡献。　　国内外学者对明末清初期间出现的历史人物多有研究，但由于种种原因，关于熊明遇的研究却极其薄弱。其实研究熊明遇的科学思想不仅可以窥见当时徐光启、李之藻等“大人物”之外的“小人物”是如何接受与发展西学，如何对待中国传统文化的，而且有助于探讨明末清初这一历史时期中国传统文化在遭遇西方文化的渗透后，做出了怎样的回应，进而为现代中国在全球化的浪潮中，如何对待中西方的文化的交融等问题提供借鉴。为此，本论文站在明末清初中西文化碰撞的历史事实基础上，采用当代人的视角去分析熊明遇的科学思想及其如何面对中西自然哲学之碰撞。力图站在今天全球文化互为影响的当代背景下去思考不同文化的碰撞与共存问题以及从熊明遇科学思想中汲取怎样的经验来应对中国科学发展历程中的问题。　　本文以熊明遇的代表作《格致草》为中心，先是对熊明遇的生活环境与生活背景进行研究，然后对《格致草》进行了详细介绍与分析，从而对其科学思想进行了述评。在此基础上对儒学与科学的发展现状进行了分析与展望，以期为中西方的文化交流作出些许贡献。