打分函数相关论文
由于抽取式摘要抽取句子有较强的人为判断主观性,不能准确客观评测出文章中实际每个句子对摘要的重要程度,以及每句话中每个词对句......
核糖核酸（RNA）是一种重要的具有多功能的生物大分子。除了众所周知的可以编码蛋白质的功能外,真核细胞中大约有97%的RNA是不编码蛋白......
蛋白质的三维结构对于研究它的功能及其相关的药物设计至关重要,多年来,科学家们提出了各种各样基于氨基酸序列的蛋白质三维结构预......
目的 利用PlanIQ 设计鼻咽癌计划质量的评估准则，并测试评估准则在鼻咽放疗计划QA(Quality Assurance)中的应用。......
亲合性打分函数由于其具有计算消耗小，计算结果准确性尚可等优点而得到了广泛的应用。一个标准的评价体系可以帮助研究者客观了解打......
亲合性打分函数(Scoring function)是一类计算蛋白-配体亲合性的方法。相关系数R 则是评价打分函数的一个重要的指标。在评价打分......
蛋白质-蛋白质相互作用是生命活动中许多重要进程的基础。在模拟蛋白-蛋白相互作用的计算方法中，分子对接由于具有精度良好、适用性......
如何准确预测蛋白-小分子结合能已成为药物设计领域一大难题。在过去几年中，基于机器学习的打分函数发展迅速，许多研究表明他们相对......
为了提高打分函数用于预测蛋白-配体亲合性的精度,我们在前期工作中发展了“基于知识的打分策略”(Knowledge-Guided Scoring,......
生物基因组研究是后基因时代研究生物信息学的热点问题。生物序列分析和分子对接是生物基因组研究中的两个研究内容。前者是研究动......
近年来，随着互联网技术发展，同构对称发布/订阅系统的应用也越来越普及。由于在同构对称发布/订阅系统中，产生的候选环匹配结果集很大......
归并比较评测方法是一种有效的比较两个搜索引擎结果质量优劣的评测方法。本文对在这类方法中考虑用户收益的方式进行了深入的研究......
TAL效应物(Transcription activator-like effectors)是黄单胞菌属植物病原菌分泌的一种特殊的三型效应物,在病原菌与寄主相互作用......
蛋白质折叠识别和远同源性检测问题是生物信息学领域的两个基础问题,解决问题的主要思想是根据蛋白质序列信息的相似度推断其结构......
核糖核酸(RNA)是生物体内重要的基本物质。在编码、解码、调节和表达基因中起重要的作用。RNA的功能主要取决于其三维空间结构,而......
RNA对生命体的遗传具有重要作用,RNA二级结构是理解RNA功能的初级钥匙。由于缺乏对RNA相对完整的了解,对RNA二级结构打分是生物信......
分子对接方法作为当今最为常用的基于结构的药物设计手段之一,其不仅能给出配体在靶标结合口袋内的正确结合模式,还可以预测两者的......
成功的分子对接程序除了需要一个有效的搜索算法来搜索构象空间外，还需要有一个合理的打分函数用于对接结果的打分和排序。在分......
本文重点探讨了药物分子设计过程中的定量构效关系、虚拟组合化学和虚拟筛选、密度泛函理论等重要新方法的发展,并对其在ADMET预测......
蛋白质-蛋白质相互作用与识别的研究是分子生物学领域的重要课题.然而由于蛋白质分子巨大,即使将蛋白质看成刚体,在没有指导信息的......
机器翻译中，在词汇、句法、语义等各个层面上，都经常遇到歧义问题，如何有效地把语言学和统计学结合起来处理歧义问题是很重要的。该文......
在人体特异性免疫应答过程中,多肽与人类白细胞抗原(Human Leukocyte Antigen,HLA)的相互作用扮演了极为重要的角色。目前,多肽与H......
蛋白质-RNA相互作用在生命活动中发挥着至关重要的作用，复合物分子间相互作用影响着生物体中基因的活动、蛋白质功能的实现等。从现......
继人类基因组计划在本世纪初落下帷幕以后，生命科学研究已跨入了后基因组时代，揭示蛋白质结构功能关系和相互作用规律成为新时期的科......
结构域是蛋白的一个结构层次,可以看作蛋白质结构,折叠,功能,进化和设计的基本单位.大多数的蛋白质都可分为若干个结构域,结构域的......
分子对接是对分子识别过程的模拟，在分子靶向药物设计等领域中有着广泛的应用。成功的分子对接程序除了需要有效的构象搜索算法，还需......
有机小分子化合物的一些基本性质如与靶标分子的亲合性、吸收、分布、代谢、排泄等药代动力学性质以及毒性(ADMET)等对于其最终是......
计算机辅助药物设计技术在现代药物研发中已经得到了普遍的运用,加速了新药研发速度,有效地降低研发成本和缩短研发周期。计算机辅......
报道了一种蛋白-蛋白相互作用表面位点的嫁接方法. 首先确定被嫁接的配体表面结合区的重要残基, 在骨架蛋白中搜索适合于嫁接这些......
目的将ROC曲线分析应用在计算机虚拟药物筛选研究领域中。方法利用分子对接软件Surflex以β-分泌酶的三维晶体结构为靶,虚拟筛选50......
目的研究多种打分函数对计算机虚拟筛选β-分泌酶(β-secretase,BACE-1)抑制剂的影响。方法采用分子对接软件Surflex虚拟筛选了50......
针对虚拟筛选过程中对接打分函数适应度低及已有数据集不平衡特点,本文提出了基于多目标粒子群优化的对接函数综合评价方法,以求解......
在不同类型复合物结合界面的物理化学特征不同的基础上,针对较难预测的Other类型复合物设计出特异性打分函数,用于在对接过程中挑......
提出了基于能量的氨基酸网络加权方式。基于该加权氨基酸网络模型，构建了新的对接打分函数。采用该打分函数对20个体系的非结合态对......
通过对相似性小于33%的1 423个蛋白质的βαβ模体序列的统计分析,选取了适合的序列固定模式长.用矩阵打分的方法,以氨基酸出现的......
从蛋白质的一级序列出发,用矩阵打分的方法对3088个蛋白质中的β发夹和非β发夹模体进行了识别.使用10-交叉检验,预测总精度为75.9......
0引言随着肿瘤免疫学的快速发展,大量研究证明,机体在抗肿瘤的过程中,毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)发挥着重要的作......
RNA二级结构的打分函数在RNA二级结构预测中扮演着越来越重要的角色。目前对RNA二级结构的打分函数并没有很好地抓住RNA的折叠机制......
蛋白质折叠类型识别是蛋白质结构研究的重要内容,折叠类型分类是折叠识别的基础。通过对ASTRAL-1.65数据库α类蛋白质所属折叠类型......
目的：将ROC曲线分析应用在计算机虚拟药物筛选研究领域中.方法：利用分子对接软件以乙酰胆碱酯酶的三维晶体结构为靶,虚拟筛选40个抑......
计算预测出TAL效应物的候选靶标有助于高效地确定TAL效应物的靶基因，进而阐明TAL效应物的生物学功能，但是目前在TAL效应物靶标计算预......
细胞内的很多重要生理过程，如细胞信号转导、免疫反应、基因复制、转录、翻译以及细胞周期调控等，都是通过蛋白质复合体或蛋白质分子......
蛋白质-蛋白质相互作用与识别的研究是分子生物学领域的重要课题。由于实验测定蛋白质复合物结构比较困难,因此,通过计算机模拟预......
分析了包含静电能 (Δ Eele)、去水化自由能 (Δ GACE)以及范德华能 (Δ Evdw)的打分函数在蛋白质蛋白质对接中评价近天然构象的能......
