结合自由能相关论文
本研究采用分子动力学模拟方法探究了互为同分异构体的2种植物雌激素芹菜素和染料木素与雌激素受体ERα及ERβ之间的结合亲和力，选......
神经退行性疾病是大脑和脊髓的细胞神经元缺失而引起的不可逆转的疾病,病因尚不明确,也无彻底治愈的特效药。近年来病患数量在不断......
艾滋病,又称获得性免疫缺陷综合症（Acquired Immunodeficiency Syndrome,AIDS）,是一种危害性极大的全球性疾病。其主要致病病原体为1......
分子动力学模拟可以用来研究生物大分子体系的各种性质,如：预测受体和配体之间的亲和力,模拟蛋白质的折叠过程,研究蛋白质与细胞膜......
本论文主要采用计算生物学方法对蛋白-蛋白、蛋白-小分子等相互作用体系进行深入研究,阐明其相互作用机理。论文包括两个课题的研......
线粒体丝氨酸羟甲基转移酶（SHMT2）在细胞内通过催化丝氨酸与甘氨酸的转化参与细胞增殖的重要原料—一碳单位（1C）的循环。研究发现SHMT2......
2019年12月由新型肺炎冠状病毒（SARS-Co V-2）感染导致的肺炎（COVID-19）疫情大规模爆发,并于2020年3月被世界卫生组织宣布为全球大流行.......
近一个世纪以来,胰岛素已经被证明是治疗糖尿病的一种关键药物。在生理条件下,血糖的调节是一个很复杂的过程,它涉及到胰岛素六聚......
癌症对人类的生活和健康有着巨大的不利影响。抗肿瘤疗法自其发明以来已经发生了巨大的变化,尤其是近年来免疫治疗一直是肿瘤治疗......
氧化还原酶主要催化生物体的氧化和还原反应,生物体的生长、代谢、繁殖等生命活动都与氧化还原反应具有非常密切的关联。对生命活......
目前,严重威胁人类健康的重大疾病包括糖尿病、癌症等等。据国际糖尿病联盟（International Diabetes Federation,IDF）在2020年发布的......
现有药物发现理念是"分子与靶标(受体)的结合亲和力(binding affinity)越强，药效越好"。然而，近年来对已经上市药物的统计结果表明......
跨膜蛋白(transmembrane protein)与细胞外配体相互作用在生物过程(如信号转导和运输)中具有重要意义。跨膜蛋白的多功能性使它们......
和高通量实验筛选技术比较，虚拟筛选技术成本低、效率高，已经成为了创新药物研发的核心技术之一。随着基因组学和结构生物学技术的发......
结核杆菌β-内酰胺酶BlaC可以水解β-内酰胺抗生素,由此而减弱了这类抗生素对结核病的治疗效果。为了克服BlaC的这种抵抗机制,临床......
ExoS 作为一种与细胞凋亡，新陈代谢等生理过程相关的蛋白，只有在14-3-3 蛋白共存的情况下才能表现出活性，而tweezer 抑制剂分子可以调......
目的 分析adc-57型头孢菌素酶分子进化及其对各种底物的结合自由能.方法 用mega 5.0软件中的最小进化法分析adc-57和其他19种β-内......
高脂血症是动脉粥样硬化性心血管疾病的一个重要危险因素，高脂血症促进动脉粥样硬化的发生发展，增加斑块的不稳定性，动脉粥样硬化斑块......
布鲁顿式酪氨酸激酶(Bruton’s tyrosine kinase)是近来治疗B细胞恶性肿瘤的明星靶点,在很多疾病和信号通路中起着关键作用,现已成......
研究发现双酚A等9种酚类化合物影响体外淋巴细胞增殖率的实验呈现特殊倒U型非单调剂量-效应关系,为探索其可能的生化机制,本文采用......
人体中的诸多化学反应，对人体自身都会产生重要影响，研究水溶液中受体和配体之间的结合自由能具有重要意义。我们首先从PDB 数据......
组蛋白乙酰化是一种调节基因的染色体表达的重要机制。我们通过分子动力学模拟(MD)方法来得到组蛋白乙酰化阅读框蛋白AF9YEATS......
准确预测结合自由能对于计算生物学和基于结构的药物设计而言是至关重要的。在众多预测结合亲和力的方法中，以MM/PBSA和LIE为代......
在过去几十年,如何精确地预测结合亲和力一直是基于受体结构的药物设计方法研究的重点。实现自由能的精准预测不仅能够大幅降......
在古细菌中发现的极端嗜热蛋白是一类高度保守的核酸结合蛋白,它在核染色质组织以及基因调节过程中有着重要的作用。极端嗜热蛋白......
蛇形蛋白SMO是Hedgehog信号通路的重要组分。GDC-0449是第一个上市的SMO靶向药,目前用于治疗晚期基底细胞癌。然而,SMO的D473H突变......
RCOK已成为新药研发的重要靶标之一,包括ROCK1和ROCK2两个亚型蛋白。虽然它们高度同源性,但大量研究表明ROCK1和ROCK2有着显著的不......
α-L-鼠李糖苷酶因其可以水解一些天然糖苷类物质如柚皮苷、芦丁等末端的鼠李糖基,在食品和生物医药工业有着广泛的应用。α-L-鼠......
应用分子对接和分子动力学方法探究白藜芦醇和雌二醇两种配体对雌激素受体(ERα、ERβ)的结合能力及结合模式.结果表明,白藜芦醇与......
细胞色素P450(Cytochrome P450,P450)酶是一类以铁卟啉环作为辅基的单氧酶。目前为止,该酶在自然界中主要有两个生理功能,一是内源......
转录因子是一种具有序列特异性的DNA结合蛋白。随着蛋白质晶体解析技术的飞速发展,已经积累了大量的转录因子核酸复合物晶体结构,......
纳米科技迅速发展,新型纳米材料的研究越来越具有战略意义。纳米材料在生物医学领域展现出蓬勃的活力,其生物安全性有待进一步的研......
α7型乙酰胆碱受体（α7-nAChR）作为攻克帕金森、重症肌无力、神经性疼痛等疾病的靶点，已经受到越来越多的重视。目前关于其激动剂的研......
目的:用分子对接、分子动力学模拟和结合自由能计算结合的方法探讨柴胡-黄芩配伍治疗酒精性肝损伤的作用靶点。方法:以环氧化酶-2(......
I型人体免疫缺陷病毒(HIV-1)蛋白酶中Asp25/Asp25’的质子化对于理论研究HIV-1蛋白酶和抑制剂的作用机制以及氨基酸变异对抗药性的......
Faldaprevir类似物(Faldaprevir analogue molecule,FAM)能有效抑制HCV NS3/4A蛋白酶的催化活性,是一种潜在抗HCV先导化合物。通过......
艾滋病病毒在世界范围内的传播,严重地威胁到人们的身心健康.HIV-1蛋白酶的残基变异严重地削弱了药物的治疗效果.为了研究残基变异......
细胞色素P450(以下简称CYP)与昆虫的抗药性密切相关。本研究运用Auto Dock分子对接技术和分子力学泊松-波尔兹曼表面积法(molecula......
目的探究整合酶的分子耐药机制。方法研究采用Discovery Studio 2.5软件模块的分子对接程序,构建整合酶药物雷特格韦(Raltegravir,......
梓醇能有效的的改善阿茨海默尔症状,但与乙酰胆碱酯酶(Acetylcholinesterase,AchE)作用的分子机制尚不明晰.本文运用分子动力学模......
随着受体一配体相互作用的理论研究以及计算机辅助药物分子设计方法的快速发展,自由能预测方法的研究受到了越米越多的关注.本......
会议
乙型肝炎核心病毒样颗粒HBc-VLPs(Hepatitis B Core Antigen Virus-like Particles)因稳定性好且易于改造,被作为疫苗载体广泛使用......
膜色谱是一种新型分离技术，膜色谱介质的合成是实现高效分离纯化的关键。运用分子模拟技术，根据目标物质的分子结构，使用分子模拟......
利用分子对接方法模拟了6种DDT类化合物与人类雌激素受体两种亚型的结合作用,结果表明o,pDDT以外的其它化合物与β亚型结合自由能......
蛋白质-配体结合能力预测是计算机辅助药物设计的重要组成部分,从上世纪80年代以来研究者进行了大量研究以获得较好的预测手段,随......
