基于宏基因组测序下呼吸道微生物群研究

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目的 了解下呼吸道微生物群组成,探索下呼吸道微生物群改变的影响因素。方法 应用宏基因组测序技术对本实验室收集的1 109例下呼吸道样本进行下呼吸道微生物群检测,并从季节、年龄、性别、抗生素使用情况4个方面进行对比分析,基于卡方检验对分类型变量进行显著性检验。结果 链球菌属(检出率=70.240%)等10个属、粘液罗氏菌(检出率=51.220%)等10个种是下呼吸道常见的微生物群成分。其中巨球形菌属(X~2=11.576,P=0.009)、拟普雷沃菌属(X~2=12.393,P=0.006)、念珠菌属(X~2=13.268,P=0.004)、Solobacterium属(X~2=11.417,P=0.009)随季节变化检出率差异显著(P<0.05)。14岁以下年龄组中链球菌属相对丰度均达到75%,与成人组(<15%)差异明显。下呼吸道主要正常菌群在男性和女性群体中检出率无显著差异(0.058<P<1)。使用抗生素组下呼吸道菌群多样性下降(P<0.001),正常菌群占比降低,耐药菌株的占比上升。结论 人体下呼吸道微生物群随季节变化、年龄增长不断演替,保持着动态平衡,而抗生素的使用会降低下呼吸道微生物群的多样性,导致耐药菌株的检出增加。
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