ARID1A通过lncRNA MVIH抑制肝癌细胞的增殖与迁移

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背景:ARID1A(AT-rich interactive domain-containing protein 1A)是染色质重塑复合物SWI/SNF(switch/sucrose non-fermenting)亚基之一,目前的研究发现ARID1A在肝癌等多种肿瘤中存在突变,ARID1A作为抑癌基因,与细胞增殖密切相关,在肿瘤的发生、发展、迁移和复发过程中发挥重要作用,但是其具体作用分子机制尚未明确。长链非编码(long non-coding RNA,lnc RNA)是一类长度大于200bp的非编码RNA,研究表明lnc RNA在包括肝癌在内的多种类型的肿瘤中存在异常表达。同时有研究报道SWI/SNF复合物可以和lnc TCF7相互作用,调节TCF7的转录激活肝癌干细胞的活性。ARID1A作为SWI/SNF复合物的一个重要亚基,其能否和lnc RNA相互作用调控肝癌的发生过程值得更进一步研究。本研究揭示了ARID1A可以和肝癌的微血管侵犯相关lnc RNA MVIH(lnc RNA associated with microvascular invasion in HCC)存在相互作用;MVIH在肝癌中呈现高表达,可以促进肝癌的生长与迁移。ARID1A与MVIH的相互作用对肝癌细胞株增殖与迁移的影响可以为肝癌的诊断和治疗提供新思路。方法:在不同的肝癌细胞株MHCC-97H、SK-HEP-1,Hep G2和Hu H7的细胞中通过RNA免疫共沉淀实验(RNA immnoprecipitation,RIP)证明ARID1A能和MVIH存在相互作用。然后使用GST pull-down实验来鉴定ARID1A和MVIH结合的结构域。之后利用western blot和q RT-PCR实验来研究ARID1A与MVIH之间的相互作用对下游基因调控的影响。最后通过克隆形成和Transwell迁移实验研究ARID1A和MVIH的相互作用对肝癌细胞株增殖和迁移的影响。结果:在不同的肝癌细胞株MHCC-97H、SK-HEP-1,Hep G2和Hu H7发现ARID1A和MVIH存在相互作用。通过GST pull-down的实验进一步证明ARID1A的氨基酸序列1-310(N端),951-1300(ARID结构域)和1901-2285(C端)和能和MVIH存在相互作用。肝癌细胞中用sh RNA将ARID1A和MVIH分别单独和共同敲减后,我们发现敲减ARID1A能够抑制p21的转录,促进肝癌细胞的增殖和迁移;而敲减MVIH能够增强p21的转录,抑制肝癌细胞的增殖和迁移,共同敲减ARID1A与MVIH能够增强p21转录,抑制肝癌细胞的增殖和迁移。结论:染色质重塑复合物SWI/SNF成员ARID1A能够与lnc RNA MVIH相互作用,并鉴定了ARID1A与MVIH结合的结构域,证明了ARID1A可能通过抑制MVIH调控p21转录,从而抑制肝癌细胞的增殖和迁移。
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