LncRNA SNHG3通过UPF1/SMAD轴促进乳腺癌进展

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目的:本研究旨在探讨lncRNA SNHG3通过调控UPF1表达并促进乳腺癌增殖、迁移、侵袭及EMT过程的分子机制。方法:通过TIMER、UALCAN等数据库基于TCGA队列数据分析lncRNA SNHG3在乳腺癌组织中的表达量,并结合qRT-PCR对其在乳腺癌细胞株中的表达加以验证;RNA荧光原位杂交技术分析lncRNA SNHG3的细胞内定位;RNAi技术构建SNHG3低表达的MDA-MB-231/si SNHG3、MCF-7/si SNHG3细胞,pc DNA3.1(+)质粒转染构建SNHG3外源性高表达的SK-BR-3/OE-SNHG3细胞,并采用CCK-8实验检测细胞的增殖能力,划痕愈合实验、Transwell实验检测迁移和侵袭能力。qRT-PCR、Western blot实验检测lncRNA SNHG3对UPF1表达的影响;RNAInter数据库预测lncRNA SNHG3与UPF1的结合,RIP实验进行验证;使用人类蛋白质图谱数据库分析UPF1的亚细胞定位;TIMER数据库分析UPF1的表达与免疫细胞浸润的相关性;GEPIA数据库分析UPF1与抑癌基因表达的相关性。RNAi技术构建低表达UPF1的MDA-MB-231/si UPF1、MCF-7/si UPF1细胞;CCK-8、划痕愈合实验、Transwell实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力改变,Western blot实验检测EMT标志物的表达变化,流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡的变化。慢病毒转染构建稳定敲低lncRNA SNHG3的乳腺癌MDA-MB-231/SNHG3-KD稳转细胞株,并共转染si UPF1;CCK-8、划痕愈合实验、微流控芯片实验、Transwell实验检测lncRNA SNHG3-UPF1表达改变对细胞增殖、迁移、侵袭能力的影响,Western blot检测EMT相关标志物的表达改变,流式细胞术检测细胞周期变化;STRING数据库分析UPF1与SMAD家族蛋白、EMT标志物的蛋白相互作用关系,Western blot实验检测TGF-β/SMAD通路相关分子的表达改变。结果:lncRNA SNHG3在乳腺癌组织及细胞株中表达显著高于正常乳腺组织及细胞;FISH实验表明lncRNA SNHG3主要定位于细胞质中;CCK-8实验、划痕愈合实验、Transwell实验显示:抑制MDA-MB-231、MCF-7细胞内源性lncRNA SNHG3的表达能显著下调乳腺癌细胞增殖、迁移、侵袭能力,但在SK-BR-3细胞中过表达lncRNA SNHG3后显示出相反的表现。qRT-PCR、Western blot实验结果表明lncRNA SNHG3下调UPF1的表达,RIP实验显示在MDA-MB-231细胞中lncRNA SNHG3与UPF1存在结合。HPA数据库分析结果表明UPF1主要定位在细胞质中;TIMER数据库分析显示UPF1与部分免疫细胞浸润成正相关;GEPIA数据库结果说明UPF1与部分抑癌基因表达成正相关。CCK-8实验、划痕愈合实验、Transwell实验、Western blot实验、流式细胞术实验显示:MDA-MB-231/si UPF1、MCF-7/si UPF1细胞的增殖、迁移、侵袭、EMT等被促进,G1期细胞数降低S期升高。成功构建慢病毒转染的MDA-MB-231/SNHG3-KD稳转细胞株后,CCK-8、划痕愈合实验、微流控芯片实验、Transwell实验、Western blot实验及流式细胞术实验结果表明:稳转细胞株增殖、迁移、侵袭、EMT过程等过程受抑制,细胞周期阻滞于G1期,稳转细胞株中敲低UPF1可部分逆转上述作用。STRING数据库和Western blot实验证明TGF-β/SMAD通路参与到lncRNA SNHG3对乳腺癌调控的过程中。结论:lncRNA SNHG3能下调UPF1通过TGF-β/SMAD通路促进乳腺癌增殖、迁移、侵袭、EMT过程。
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