CNPY4在低级别胶质瘤中的预后价值及临床意义的研究

来源 :山西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lho001
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目的:研究冠层FGF信号调节器4(Canopy FGF Signaling Regulator 4,CNPY4)的表达在低级别胶质瘤(Low-Grade Glioma,LGG)中的表达和预后差异,分析CNPY4与肿瘤免疫之间关系,并预测CNPY4在胶质瘤中对替莫唑胺(Temozolomide,TMZ)和顺铂的药物敏感性。方法:通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和中国胶质瘤基因组图谱(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)两个独立的数据库以及基因型组织表达(The Genotype-Tissue Expression,GTEx)正常组织数据库,得到CNPY4的表达信息、预后信息和临床表型特征,然后通过在线分析软件以及R软件进行数据整理和分析。首先分析CNPY4在胶质瘤中的在RNA水平的差异表达,并通过人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas,HPA)数据库验证CNPY4在蛋白水平的表达差异,然后分析CNPY4的差异表达对胶质瘤生存的影响。此外,通过肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)和肿瘤免疫系统交互的集成存储库门户(Integrated Repository Portal for Tumor-Immune System Interactions,TISIDB)来研究CNPY4与肿瘤浸润免疫细胞(Tumor Infiltrating Iimmune Cells,TIICs)之间的相关性,然后使用肿瘤免疫功能紊乱和排除(Tumor Immune Dysfunction and Exclusion,TIDE)算法预测CNPY4的表达对免疫检查点阻断(Immune Checkpoint Blockade,ICB)的响应性。最后通过基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)来分析CNPY4可能的功能通路,并用COX回归和半数最大抑制浓度(Half-Maximal Inhibitory Concentration,IC50)分析CNPY4对胶质瘤预后和药物敏感性的影响。结果:1、CNPY4在胶质瘤中高表达,作为胶质瘤的关键基因,与较高的胶质瘤世界卫生组织(World Health Organization,WHO)分级相关;2、CNPY4作为一种新型分子标志物是LGG的独立预后因素,CNPY4的高表达提示LGG预后不良;3、CNPY4可能通过调节TIICs及其调节分子影响LGG的预后和发展,CNPY4低表达的胶质瘤患者具有更高的ICB响应性;4、CNPY4的高表达可能提示LGG患者对替莫唑胺和顺铂的敏感性。结论:1、CNPY4作为一种新型分子标志物是低级别胶质瘤(LGG)的独立预后因素,CNPY4的高表达提示LGG预后不良;2、CNPY4可能是潜在的免疫治疗靶点并可预测替莫唑胺和顺铂的高敏感性。
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