【摘 要】
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目的:通过研究焦亡相关基因在胃癌中的表达情况和其与预后的关系,构建一个与焦亡相关的预后模型和诺模图来预测胃癌患者的预后,并且探索胃癌中焦亡相关基因与免疫细胞的相关性。方法:通过TCGA数据库下载胃癌患者的转录组测序数据、生存信息和临床信息。于人类基因数据库中获取焦亡相关基因。用“LIMMA”R软件包和单因素Cox分析寻找TCGA队列中有差异表达和预后价值的焦亡相关基因,并对这些基因进行GO富集和K
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目的:通过研究焦亡相关基因在胃癌中的表达情况和其与预后的关系,构建一个与焦亡相关的预后模型和诺模图来预测胃癌患者的预后,并且探索胃癌中焦亡相关基因与免疫细胞的相关性。方法:通过TCGA数据库下载胃癌患者的转录组测序数据、生存信息和临床信息。于人类基因数据库中获取焦亡相关基因。用“LIMMA”R软件包和单因素Cox分析寻找TCGA队列中有差异表达和预后价值的焦亡相关基因,并对这些基因进行GO富集和KEGG富集分析。将所选基因纳入多因素Cox分析,构建预后模型。将风险评分中位数作为截断值,将胃癌患者划分为高风险和低风险两组,Kaplan-Meier生存分析和ROC曲线生存分析用于风险评分预后预估能力的评估。为了更好佐证我们模型的有效性,在GEO数据集中搜寻了GSE66229、GSE84437两个数据集作为验证集进行外部验证。通过结合风险评分和胃癌患者临床病理特征建立预测胃癌患者生存概率的诺模图。最后对胃癌患者风险评分与免疫细胞浸润情况进行了相关性分析。结果:1:最终建立了包含10个基因（BIRC2、CD274、IRGM、ANXA2、GBP5、TXNIP、POP1、GBP1、DHX9、TLR2）的预后模型。与低危组胃癌患者相比,高危组胃癌患者的结局更加不良。外部验证集GSE84437和外部验证集GSE66229的验证结果也很好的证明了我们的研究。该风险评分可以作为胃癌患者独立的预后指标。低危患者在＞65岁、≤65岁、男性、女性、G1-2、G3、M0、N1-3、I-II期、III-IV期和T3-4期这些分组中均有较好的预后。2:根据风险评分和临床病理特征建立的诺模图,可以预测胃癌患者的1、3年生存率。3:树突状细胞、巨噬细胞、中性粒细胞与风险评分呈正相关。结论:1.首次建立了与焦亡相关基因的预后模型来预测胃癌患者的预后。2.构建了基于焦亡相关基因的预测患者预后的诺模图,可以准确预测患者1年和3年的生存率,对临床诊断预后有较大的价值。
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