肠道病毒71型2C蛋白的结构生物学研究及药物筛选

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目前手足口病主要流行于亚太地区,患者多为婴幼儿,其病症表现为大量疱疹出现在手掌、脚掌以及嘴周围皮肤等部位并伴有高烧发热。EV71是引发手足口病的主要病原体之一,与其他手足口病病原体不同的是EV71常引发重症手足口病,重症患者伴有神经系统并发症,有较高的死亡率。而目前还没有针对EV71有效的抗病毒药物。EV71的2C蛋白具有解螺旋酶活性,并参与了诸如病毒脱壳、细胞膜重排、RNA复制、免疫逃逸和病毒的衣壳化等的EV71多项生命活动。由于在病毒生命周期中行使多项功能,2C蛋白具有非常重要的研究价值,以2C蛋白为靶点设计相应抗病毒药物的开发越来越受到关注。本课题通过设计纯化实验方案获得了高纯度的2C蛋白,并对其进行结晶学研究,遗憾的是晶体未能发生衍射。在2C蛋白的先导化合物的筛选方面,我们首先基于2C蛋白结构(PDB:5GQ1)进行虚拟筛选,并通过thermal shift的方法验证可能的化合物与2C蛋白之间的相互作用。从thermal shift实验中发现多个小分子会导致2C蛋白的熔解温度下降,其中分子21-G10有较强的作用信号。使用AutoDock进行分子对接,推测其作用位点在2C蛋白多聚化的作用面上。通过对21-G10结合模式以及结合参数(结合能、抑制常数)的进一步优化,我们期望能寻找到结合能力和特异性更强的小分子化合物。
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