橡胶草TkCPT1基因的生物信息学分析及功能验证

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sunrise12345678
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TkCPT1基因是橡胶草(Taraxacum kok-saghyz)合成顺式橡胶过程中的一个重要基因.本实验运用生物信息学手段对橡胶草中顺式异戊烯基转移酶(cis isoprene transferase,CPT)进行一系列特征分析,并利用农杆菌介导的遗传转化法,通过超量表达TkCPT1基因遗传转化烟草,获得转基因烟草植株后对其进行比较分析.结果 显示,橡胶草的CPT基因与烟草(Nicotiana tabacum)的一部分CPT基因在进化关系上更近,且鉴定的这4个物种(橡胶草,橡胶树(Hevea brasiliensis),拟南芥(Arabidopsis thaliana),烟草)CPT蛋白的基序共鉴定15个保守基序,其中基序1~基序6几乎由所有CPT蛋白共享,在进化关系上TkCPT和NtCPT1、NtCPT10、NtCPT11和NtCPT13更近.对TkCPT1编码蛋白的氨基酸序列进行理化特性分析,结果显示该蛋白二级结构和三级结构与预测的基本一致;对转基因植株与野生型植株进行观察发现,转基因植株开花提前7d,RT-PCR分析开花基因表达上调,但是二者株高和茎粗没有区别.TkCPT1基因可能影响开花基因的表达,导致转基因植株提前开花,这为进一步探索TkCPT1基因功能奠定基石.
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