巴西橡胶树HbRPS6—2基因的克隆与生物信息学分析

来源 :热带作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jinyu9782
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从巴西橡胶树甲基化过滤文库中筛选到一个与RPS6同源性较高的基因片段.根据该基因片段序列信息,设计特异引物,利用RACE进行特异片段的5’和3’扩增,获得长度为1327bp的HbRPS6—2基因克隆。生物信息学分析表明,该基因包含483bp的开放阅读框,5’非翻译区为357bp,3’非翻译区为475bp,编码161个氨基酸。在HbRPS6—2氨基酸序列中没有预测到信号肽和跨膜区.二级结构分析表明其属于混合型蛋门。HbRPS6—2在N端前18个氨基酸区域内有一个较强的疏水区.但整条多肽链表现为亲水性。对15
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