【摘 要】
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荷叶离褶伞(Lyophyllum decastes)胞外酶具有较高的漆酶活性,漆酶在其子实体发育中发挥着重要的作用.荷叶离褶伞基因组已完成测序,但未注释.目前,鲜有其漆酶基因的报道.本研究采用同源预测的方法对其漆酶基因进行预测并对其编码蛋白的生物特性进行探究.以灰盖鬼伞(Coprinopsis cinerea)的漆酶氨基酸序列对荷叶离褶伞的全基因组序列进行tblastn比对,再通过Augustus进行基因预测分析得到其cDNA和蛋白序列,用Blastp验证筛选获得19个可能的荷叶离褶伞的漆酶基因.采用Pr
【机 构】
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河西学院,祁连山食用菌产业协同创新中心,甘肃省应用真菌工程实验室,甘肃省食用菌遗传育种重点实验室,张掖,734000
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荷叶离褶伞(Lyophyllum decastes)胞外酶具有较高的漆酶活性,漆酶在其子实体发育中发挥着重要的作用.荷叶离褶伞基因组已完成测序,但未注释.目前,鲜有其漆酶基因的报道.本研究采用同源预测的方法对其漆酶基因进行预测并对其编码蛋白的生物特性进行探究.以灰盖鬼伞(Coprinopsis cinerea)的漆酶氨基酸序列对荷叶离褶伞的全基因组序列进行tblastn比对,再通过Augustus进行基因预测分析得到其cDNA和蛋白序列,用Blastp验证筛选获得19个可能的荷叶离褶伞的漆酶基因.采用ProtParam、SignalP 5.0、Sompa和TMHMM 2.0等生物信息学工具进行预测并分析荷叶离褶伞漆酶的理化特性、信号肽和跨膜结构的组成成分.本研究为荷叶离褶伞漆酶的分子作用机制研究和其它食用菌漆酶的研究提供数据参考.
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