肺癌患者血浆外泌体microRNAs标志物的筛选

来源 :癌变·畸变·突变 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bobby_hong
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目的:筛选肺癌患者血浆外泌体中的异常microRNA(miRNA),以期为肺癌筛查及辅助诊断提供新的标志物和方向。方法:选择6名肺癌患者(腺癌3例、鳞癌2例,小细胞肺癌1例)和4名健康对照者血浆样本,采用差速离心法提取血浆外泌体,采用Agilent Bioanalyzer对抽提的RNA进行质量检验,对血浆外泌体miRNA进行高通量测序分析,采用TargetScan、PITA和miRNAorg数据库进行靶基因预测,应用R软件进行靶基因的KEGG和GO分析。结果:miRNA表达分析发现,与正常对照者比较,肺癌患者血浆外泌体中有142种miRNAs表达异常,其中62种miRNAs表达上调,80种miRNAs表达下调。GO分析显示,这些miRNAs的靶基因主要参与了以DNA为模板的转录、转录调控及信号转导等。KEGG分析显示,这些miRNAs的靶基因主要参与轴突导向信号通路、钙信号通路、肌动蛋白细胞骨架调节等。结论:通过对肺癌患者和健康对照者血浆外泌体miRNAs进行高通量测序,初步筛选出差异表达miRNA,经生物信息学分析,推测其对肺癌转移具有良好预测潜力,有望成为肺癌筛查和辅助诊断的候选生物标志物。
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