全外显子组测序对于智力障碍或全面发育迟缓患者的诊断价值

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目的

探讨全外显子组测序(WES)对于智力障碍(ID)或全面发育迟缓(GDD)患者的诊断价值。

方法

选取2018年5月至2021年12月于郴州市第一人民医院就诊的134例ID或GDD患者为研究对象。采集患者及其父母的外周血样进行WES检测,对候选变异进行Sanger测序/拷贝数变异测序(CNV-seq)验证和家系来源分析,对候选变异根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)变异分类标准进行致病性评估。

结果

在134例患者中,共检出致病性单核苷酸变异(SNV)及小片段插入/缺失(InDel)46例,致病性基因组拷贝数变异(CNV)11例,单亲二倍体(UPD)1例,总体阳性检出率为43.28%(58/134)。46例致病性SNV/InDel共涉及40个基因62个位点,其中最多的是MECP2基因(n=4)。11例致病性CNV中,10例为缺失变异,1例为重复变异,片段范围为0.76 ~ 15.02 Mb。1例患者在15q11.2q12区存在约15.62 Mb的杂合性丢失(LOH),结合家系WES数据提示为父源性UPD,结合其临床表型诊断为Angelman综合征。

结论

WES不仅能够高效检出SNV/InDel,对CNV、LOH也有较高的检出率,结合家系数据分析能够准确判断变异的来源,这些优势表明WES对ID或GDD患者的遗传学病因诊断具有重要的价值。

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