通过基于iTRAQ的蛋白组学方法筛选与TGF-β1调控瓣膜间质细胞活化相关的关键蛋白

来源 :中国细胞生物学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fredzhuca
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瓣膜间质细胞(valve interstitial cells,VICs)由成纤维细胞表型分化为肌成纤维细胞表型,即VICs活化是驱动瓣膜纤维化病变的早期关键环节,而转化生长因子-β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)是诱导VICs活化的经典细胞因子,该文利用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术对TGF-β1处理前后的VICs进行了差异蛋白质组学分析,以期发现与VICs活化相关的关键蛋白。该研究以原代培养的大鼠VICs为对象,利用蛋白组学方法分析TGF-β1处理VICs前后蛋白质表达谱的变化,通过多种生物学信息分析方法对重点差异蛋白进行筛选,并利用qRT-PCR与Western blot法验证候选蛋白的表达差异。结果显示,共鉴定出可定量差异蛋白7 104个,其中包括具有显著差异(P<0.05)的上调蛋白404个、下调蛋白494个。GO分析显示差异蛋白主要富集到多细胞生物学过程、DNA结合功能以及细胞外基质区域组分等功能条目中,KEGG分析显示差异蛋白主要参与DNA复制、错配修复及黏着斑等信号通路。此外,进一步发掘出了AKAP12、FBLN2、NCAM1、MFAP4以及CADM4等5种与VICs活化相关的新型候选蛋白。该研究全面解析了TGF-β1处理前后的VICs差异蛋白表达谱,为进一步阐明VICs活化与瓣膜性心脏病的发生机制提供了新的线索。
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