LncRNAs在线虫天然免疫中作用的研究

来源 :云南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sgjies
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
非编码RNA不编码蛋白质,其作用主要表现为在RNA水平调控生物体的生命活动。目前,研究根据非编码RNA的长度将其分为small RNA和lncRNA(long non-coding RNA),其中small RNA长度在19-31nt之间以与转录基因互补、介导基因沉默的miRNA为典型代表。lncRNA大小超过200个核苷酸参与调控许多细胞过程,如染色质重塑,转录和基因表达。它们在人类许多癌症的发展中发挥重要作用。最近关于lncRNA在哺乳动物中的研究比较普遍,也呈现出了很大的研究前景。为了探究线虫lncRNA是否在线虫天然免疫中起作用,我们首先用RNA-seq技术分析秀丽隐杆线虫经病原菌铜绿假单胞杆菌PA14侵染后的lncRNA表达谱,发现与喂食标准食物大肠杆菌OP50的线虫相比,有20个lncRNAs表达上升,有2个表达下降。我们推测上调的lncRNA可能通过某种机制调控线虫的天然免疫。通过对其中17个上调的lncRNAs进行RNA干扰载体构建,进而进行RNAi实验。我们发现线虫经lncRNA TCONS00177904或lncRNA TCONS00116737干扰后对铜绿假单胞菌PA14的敏感性增强,表明lncRNAs TCONS00177904和TCONS00116737在线虫抵抗病原菌PA14的天然免疫中起正调控作用。通过生物信息学分析的结果表明,lncRNA TCONS00177904可通过碱基互补配对结合microRNAs(miRNA)miR-250和miR-243;lncRNA TCONS00116737可通过碱基互补配对结合miR-45、miR-77、miR-71、miR-54、miR-73和miR-47。用以上miRNA的突变株进行验证,发现这些miRNAs的突变对于秀丽隐杆线虫抵抗铜绿假单胞杆菌的能力并没有影响。对miR-250或miR-243突变株进行lncRNA TCONS00177904干扰以及对miR-45、miR-77、miR-71、miR-54-55、miR-73-74或miR-47突变株进行lncRNA TCONS00116737干扰与对野生型秀丽隐杆线虫进行lncRNA TCONS00177904或lncRNA TCONS00116737干扰相比,它们对PA14的抵抗能力都没有显著差别。由此说明线虫lncRNAs TCONS00177904和TCONS00116737并不是通过吸附miRNA来调控下游mRNA的机制来调控线虫的天然免疫。综上所述,秀丽隐杆线虫在受到铜绿假单胞菌PA14侵染时,线虫体内的部分lncRNAs表达上升,其中lncRNAs TCONS00177904和TCONS00116737的上调使线虫对铜绿假单胞菌的抵抗增强,即lncRNAs TCONS00177904和TCONS00116737在线虫的天然免疫中发挥作用。
其他文献
微生物燃料电池(MFC)是一种利用细菌通过生物质产生电能的新方法,其产电性能受反应器构型、电极材料、基质的直接影响,底物因能为MFC中的产电菌提供能源,被认为是影响MFC产电最重要的因素。为提升底物中能被产电菌利用的物质含量,本实验采用低温热解与过氧化氢结合的热氧化法对污泥进行破解,因过氧化氢在氧化过程中不产生污染物,所以热氧化法与MFC技术的结合值得期待。为此,本实验将热氧化法预处理后的污泥作为
甘青民族走廊地跨甘肃、青海两省,这里是游牧文化与农耕文化的结合部,也是我国重要的多民族聚居、多宗教共存的区域,具有丰厚的历史文化内涵。明清以来,在甘青民族走廊内生活
现代社会是信息化社会,人们的生产、生活处处受其影响,教育也不例外。各种网络公开课、MOOC、教育软件如雨后春笋般涌起,人们利用互联网技术足不出户就可以学习来自世界各地
由于电动轮与传统悬架匹配存在占用空间大、硬件干涉,与主动悬架相匹配又存在耗费能量大、制造成本高等问题,本文设计提出了双磁流变减振器悬架结构,且基于电动轮集成技术,将悬架结构整合于车轮之中,并对该悬架动力学特性和振动控制进行深入研究。具体工作包括以下几方面:在提出的适用于电动轮汽车的双磁流变减振器悬架结构的基础上,计算确定了磁流变减振器结构尺寸,并采用Maxwell、Simulink软件分别对减振器
全球气候变化对陆地生态系统森林碳氮循环过程有重大影响。我国中亚热带常绿阔叶林是全球极为重要的森林碳汇区,研究气候变化对亚热带森林生态系统的影响意义深刻。本试验样
本论文主要研究限制性路构建问题,包括两个基本内容,即限制性路增广问题和限制性路构建问题。限制性路增广问题可以描述为:给定一个有向图D =(V,A;c)以及图D中的一条s-t有向
亚纯函数的正规族理论是复分析的一个重要组成部分,许多国内外数学工作者对此作出了突出的贡献,并且获得丰硕的研究成果,本文主要证明了两个结果.一个是涉及零点与多项式的正规定则:设F为区域D内的一族亚纯函数,k,q为正整数,h(z)为区域D内不恒为零的全纯函数,若对任意的f∈F,f(z)≠0,且(f(k)(z))q至多有q(k+1)-1个不同零点(不计重数),那么F在D内正规.另一个是涉及分担集合的正规
排序调度问题是组合优化领域里最受关注的问题之一,应用于工业生产,物流调度,设施选址等生活领域中。在大多数关于排序调度问题的文献里,要求所有的任务必须被安排在机器上加
文章首先简单介绍了偏微分方程的起源及发展过程,以及自己研究生阶段所学习的一些课程.主要研究了有界洞型区域内双调和方程边值问题的可解性以及半线性椭圆型方程组的可解性.证明了双调和方程边值问题正解的存在性与唯一性,同时对解的不存在情形进行了探索,并对半线性椭圆型方程组边值问题给出了正解的存在性及其唯一性证明.论文中主要运用的方法有不动点定理,Green恒等式,最大值原理等.
噬菌体裂解酶是噬菌体在感染细菌后期表达的一类细胞壁水解酶,有着不可增殖、易于定向操作、无(较少)细菌抗性影响的优点,但也有着裂解谱窄,热稳定性差等缺点。复合酶制剂虽然可以弥补这一系列噬菌体裂解酶存在的缺陷,但需将不同酶分别生产再进行配比混合,增加了不少人力物力的投入。通过现代基因工程技术将两种酶融合,把其优点进一步的结合利用,得到新的融合酶可以较好的克服以上缺陷。本文利用亚栖热菌(Meiother