C.elegans芳香烃受体调控基因的发现——mRNA-tagging的研究

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本论文的主要目的是建立用于mRNA-tagging的转基因C.elegans,希望通过利用mRNA-mggmg技术富集C.elegans感觉神经元中mRNA的方法,用获得的mRNA进行RDA(Representational difference analysis of cDNA),以解决直接用总RNA进行RDA构建减数文库高背景的问题。 本研究首先以C.elegans基因组DNA为模板,扩增得到mec-3基因启动子(mec-3p);再以pPRSK9为模板,扩增得flag-pab-1融合基因,并分别将这两段基因克隆入载体pBluescript<Ⅱ>SK(+/-),得到重组质粒pMec-3p-flag-pab-1。 利用基因枪打靶方法(microparticle bombardmem)将重组质粒pMec-3p-flag-pab-1和pDP#MM016b(unc-119 rescuing质粒)共同转染成年的unc-119突变虫株(ed3)。挑取转化子进行单线虫的克隆化培养,并根据其F1代是否有unc线虫的出现而继续进行6代遗传筛选。筛选出的稳定虫株再与ed3回交5次,最后进行PCR鉴定flag-pab-1基因的存在,结果获得了纯合的转基因虫株,命名为y11(基因型:unc-119(-/-);pDP#MM016b(+/+);pMec-3p-flag-pab-1(+/+);ahr-1(+/+));然后将ahr-1突变虫株ia03与ed3虫株杂交,通过遗传筛选和PCR筛选得到了缺失ahr-1和unc-119基因的双突变虫株,命名为y12,其基因型:unc-119(-/-);ahr-1(-/-);由yl1与yl2杂交用遗传筛选和PCR筛选得到了转染了pMec-3p-flag-pab-1和pDP#MM016b质粒并缺失ahr-1基因的虫株,命名为yl3(基因型:unc-119(-/-);pDP#MM016b(+/+);pMec-3p-flag-pab-1(+/+);ahr-1(-/-))。 yl1与yl3转基因虫株的融合表达鉴定:针对flag-pab-1的mRNA序列设计引物,以yl1、yl3提取的总RNA为模板,用引物对flag-pab-1基因进行RT-PCR,结果在yl1与yl3都能扩增出相应大小的片段,表明外源的flag-pab-1融合基因能在转基因虫株中正常转录;用抗FLAG的单抗和异硫氰酸荧光素标记的羊抗小鼠IgG二抗进行免疫组化,结果显示在yl1与yl3虫株的ALML/R、FLPL/R、PVM、AVM等神经元细胞所在位置可见绿色荧光,表明融合基因flag-pab-1在转基因yl1与yl3虫株的这些感觉神经元中有表达。 最后,大量培养同期化的转基因yl1线虫,用超声破碎线虫,离心后得到的蛋白质上清与抗FLAG的单抗结合的琼脂珠孵育,进行免疫沉淀以富集与FLAG-PAB-1融合蛋白结合mRNA,对获得的mRNA进行线性扩增。结果:线性扩增后并未得到可以检测到的mRNA。本研究获得了可以用于后续mRNA-tagging研究的2个转基因虫株。
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