【摘 要】
：
目的:喉鳞状细胞癌是头颈部最常见的恶性肿瘤之一。目前喉鳞状细胞癌的治疗策略包括多种疗法的组合。尽管有了改进的诊疗策略和更准确的治疗方法,但在过去40年中,喉鳞状细胞癌的5年生存率并未明显提升。因此,早期检测喉鳞状细胞癌,探索其分子标记以及新的治疗靶标至关重要。本研究通过对喉鳞状细胞癌转录组的测序数据及患者生存、临床资料进行生物信息学分析,构建一种与糖酵解相关基因组成的预测标签,作为预后风险标签。方
论文部分内容阅读
目的:喉鳞状细胞癌是头颈部最常见的恶性肿瘤之一。目前喉鳞状细胞癌的治疗策略包括多种疗法的组合。尽管有了改进的诊疗策略和更准确的治疗方法,但在过去40年中,喉鳞状细胞癌的5年生存率并未明显提升。因此,早期检测喉鳞状细胞癌,探索其分子标记以及新的治疗靶标至关重要。本研究通过对喉鳞状细胞癌转录组的测序数据及患者生存、临床资料进行生物信息学分析,构建一种与糖酵解相关基因组成的预测标签,作为预后风险标签。方法:1.从TCGA癌症基因组图谱获得喉鳞状细胞癌和正常组织相关基因表达谱的数据及患者生存、临床资料。2.结合分析GSEA中的3个糖酵解相关基因集与喉鳞状细胞癌和正常组织间差异表达筛查出最显著的基因,并使用单因素及多因素cox比例回归模型进行糖酵解预后相关基因表达的筛选构建预测标签。3.Kaplan-Meier曲线用于分析预测标签对喉鳞状细胞癌患者预后的预测能力,ROC曲线验证预测标签的预后效能。4.使用c Bio Portal for Cancer Genomics在线工具分析筛选得到的喉鳞状细胞癌糖酵解相关基因的突变。5.单因素及多因素Cox回归分析糖酵解相关基因组成的预测标签与其他临床变量的相关性。结果:1.获得111例喉鳞状细胞癌组织及12例喉癌旁正常组织的基因表达谱和相应患者的临床信息。结合GSEA中的3个糖酵解相关基因集与喉鳞状细胞癌和正常组织间差异表达交叉分析,并使用单因素及多因素cox比例回归模型进行预后糖酵解相关基因表达的筛选并构建预测标签,筛查出差异表达最显著的预后相关基因STC2及LHPP组成的风险预测标签。2.筛选得到2个糖酵解相关基因各自的回归系数和与患者组织标本的基因表达值,计算每位患者的风险评分值（Risk score）。利用公式,风险评分=（0.044871×STC2的表达值）+（-0.18179×LHPP的表达值）。所选基因数据集中的111例喉鳞癌患者根据风险评分中位数值分为高风险组（n=55）和低风险组（n=56）。3.分析高低风险组的患者预后差异。相较于低风险组患者,高风险组患者与总体生存时间均显著降低（P=0.003）。受试工作特征曲线（ROC）分析风险预测标签的5年预后效能AUC值为0.755,提示该预测标签在预测喉鳞状细胞癌患者预后方面有出色表现。4.单因素及多因素Cox回归分析评估这2个糖酵解相关基因组成的预测标签是否独立于临床相关变量,结果发现风险评分risk score依然与患者总体生存时间（OS）呈显著相关性,提示该预测标签可能为喉鳞状细胞癌患者的独立预后因子。结论:STC2在喉鳞状细胞癌组织中高表达,且可能与头颈鳞状细胞癌不良预后相关。STC2及LHPP组成的预测标签可能是头颈鳞状细胞癌预后的独立风险标签。本研究新构建了一种与糖酵解相关的预测标签作为喉鳞状细胞癌患者预后风险标签,为喉鳞状细胞癌的研究和个体化肿瘤代谢途径治疗提供了新的思路和分子靶点。
其他文献
目的:我们的目的旨在研究阿帕替尼在转移或局部复发鼻咽癌（NPC）患者中的疗效和安全性。方法:一项多中心、单臂、前瞻性II期临床研究在至少经历过一线化疗失败的复发或转移性鼻咽癌的患者中进行,入组患者年龄为18-70岁。排除复发性肿瘤侵犯或包绕大血管的病例,给与阿帕替尼（500mg/d）单药维持治疗,四周为一个疗程,直到疾病进展、发生不可耐受的毒性反应或退出研究。本次研究的主要终点是客观缓解率（ORR
目的:本研究旨在探讨糖原合成激酶GSK-3β表达差异在脊索瘤细胞中增殖、迁移侵袭、凋亡和调控脊索瘤发生的功能,以及GSK-3β-P21调控通路在脊索瘤进展中的作用。方法:1)收集41对从桂林医学院附属医院手术切除的脊索瘤和正常癌旁组织标本（术前未经过放化疗）,采用蛋白质免疫印迹（Western blot）的方法研究脊索瘤组织和及其癌旁正常组织的GSK-3β的蛋白表达水平,利用免疫组化（IHC）实验
目的:明确m6A甲基转移酶METTL14在甲状腺癌中的表达情况,分析METTL14的表达与甲状腺癌患者临床病理特征的关系,通过体外实验研究METTL14对甲状腺癌细胞生物学功能的影响,初步探究METTL14在甲状腺癌中的下游调控机制。方法:收集40对甲状腺癌患者及正常人血样,运用qPCR方法检测METTL14在甲状腺癌患者及正常人中的表达情况;另外,收集56例甲状腺癌患者的甲状腺癌组织及36例非甲
目的:目前,临床上对于甲胎蛋白（Alpha-fetoprotein,AFP）阴性（≤20 ng/ml）肝细胞癌（Hepatocellular carcinoma,HCC）根治性切除术后复发监测和生存预后评估尚缺乏有效的生物标志物。方法:回顾性分析606例接受肝癌根治切除术患者的临床病理资料,其中AFP阴性组303例,AFP阳性组303例。针对患者术后一年内是否复发,采用受试者工作特征（ROC）曲线
目的:探讨巨噬细胞炎性-1ɑ（MIP-1ɑ）与Erk1/2/Bax信号通路在骨髓瘤骨病（MBD）患者中的表达及临床意义和MIP-1ɑ拮抗剂联合硼替佐米通过抑制Erk1/2/Bax促进骨髓瘤骨病成骨作用。方法:选取MBD患者骨髓液22例（实验组）及正常人的骨髓液8例（对照组）,采用皮下注射IM-9骨髓瘤细胞株方法构建MBD小鼠模型,随机分为4组,按药物给予分别为对照组、硼替佐米（Bor）组、MIP-
目的:肝癌作为最常见的肿瘤之一,迄今为止,肝癌的初步筛查以及血液学诊断仍依赖于血清甲胎蛋白（Alpha fetal protein,AFP）值。然而临床上仍有30%-40%的肝细胞肝癌（Hepatocellular carcinoma,HCC）患者甲胎蛋白呈阴性,这一现象造成一部分患者的诊断难度增加,甚至延误早期治疗。目前对外泌体与肝癌之间关系的研究仍较少,本研究将通过肝癌患者血浆外泌体蛋白质组学
目的:有研究显示4K评分结果小于7.5%的人群患有中高危前列腺癌（PCa）的风险较低。本研究采用meta分析的方法,系统评价4K评分在接近7.5%的阈值范围内（7.5%-10%）检测中高危PCa的诊断准确性。方法:通过Pub Med、Embase和Cochrane Library检索截止2021年2月前发表的相关文献。根据纳入、排除标准对文献进行筛选,对纳入文献进行质量评估,提取数据用于绘制森林图
目的:乳酸脱氢酶（Lactate dehydrogenase,LDH）已被证实在多种实体肿瘤存在高表达,但与转移性前列腺癌预后关系仍存在争议,因此,本研究通过meta分析来全面综合评价乳酸脱氢酶与转移性前列腺癌在预后方面的关系,以期更好的了解乳酸脱氢酶在转移性前列腺癌患者中的预后价值的应用。方法:通过电子计算机手动搜索PubMed数据库、EMbase数据库、Web of Science数据库、Co
目的:观察α-突触核蛋白基因在胃癌组织中的表达情况,分析其与胃癌临床分期,病理分化程度之间的关系,进一步探求预防及治疗胃癌的有效办法的可能性。方法:研究对象为2019年5月至2019年8月期间桂林医学院附属医院胃肠外科收治的进展期胃癌患者,术中取新鲜胃癌组织和癌旁组织,均置于液氮中冷冻保存（术前经胃镜病理结果或术后常规病理学诊断确诊为胃癌）,然后根据临床分期和组织分化分为不同的亚组。分别对癌组织和
目的:探讨视频脑电图（video electroencephalogram,V-EEG）的背景脑电图和睡眠中非快速眼动睡眠Ⅱ期脑电图,对急性脑梗死意识障碍患者诊断和预后评估的临床价值。方法:急性脑梗死意识障碍患者在一周内采用昏迷恢复量表（coma recovery scale—revised,CRS-R）评分和视频脑电图检查。CRS-R评分需要重复3次并采用最高评分,脑电图按照国际10-20系统安