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目的:头颈部鳞癌(HNSCC)主要是对口腔、鼻咽、口咽、下咽、喉部和颈部恶性肿瘤的总称,约占头颈部癌症的90%,目前认为吸烟、饮酒、HPV和EBV感染以及基因表观遗传与其密切相关。尽管近几十年头颈部恶性肿瘤在综合诊疗策略上有一定的进展,但是其预后依旧不容乐观。本研究旨在开发和验证一种基于内质网应激相关基因所构建的预后模型,通过此模型来评估HNSCC患者的临床预后,从而找到有效的诊断指标并制定更好的治疗策略。方法:1.从GDC网站获取癌症基因组图谱(TCGA)下载HNSCC转录组数据以及相应的患者年龄、性别、生存状态、临床分期等相关临床数据。2.从GSEA官方网站中获取15个内质网应激相关基因集,并筛选出在头颈部鳞状细胞癌以及癌旁组织间存在差异化表达的8个内质网应激相关基因集。将其作为原始数据,然后借助R语言筛选出差异化表达最显著的基因。在此基础上,借由构建单因素及多因素Cox回归模型,进而搭建头颈部鳞状细胞癌预后风险标签。3.通过Kaplan-Meier曲线分析步骤2所构建的头颈部鳞状细胞癌预后风险标签的工作效能,后续进一步借由绘制ROC曲线验证来判断预后风险标签的预后效能。4.c Bio Portal for Cancer Genomics在线分析工具用于甄别步骤2所获取的头颈部鳞状细胞癌中内质网应激相关的最显著基因,分析这些基因在头颈部鳞状细胞癌患者中具体的突变频率以及突变类型。5.借由单因素和多因素Cox回归模型,分别评估内质网应激最显著基因所组成的预后风险标签与患者其他临床资料的相关性。结果:1.为后续的实验获取502例头颈部鳞状细胞癌组织和相关44例癌旁组织的基因表达数据以及相应患者的临床数据。通过分析GSEA中的15个内质网应激相关基因集在头颈部鳞状细胞癌和癌旁组织之间的差异化表达,得到表达差异最显著的8个基因集,为其构建单因素和多因素Cox回归模型,并借此构建由最显著预后相关基因USP14、ABCA7、UFM1、CANX、ITPR1、TOR1A、BCAP31、TRIB3所组成的预后风险标签。2.计算得出上述8个内质网应激预后相关基因所对应的回归系数,同时结合患者组织标本的基因表达数值,获取每个样本所对应的风险评分(Risk score)。根据公式可以得出,样本风险评分=(0.012381782×USP14的表达值)+(-0.09859901×ABCA7的表达值)+(0.032697997×UFM1的表达值)+(0.004664378×CANX的表达值)+(-0.189184955×ITPR1的表达值)+(0.04231108×TOR1A的表达值)+(0.003495721×BCAP31的表达值)+(0.012438658×TRIB3的表达值)。所选基因数据集中502例样本排除临床数据缺失3例,剩余的499例头颈部鳞状细胞癌患者根据风险评分中位值,可以进一步划分为高危组(n=249)和低危组(n=250)两组。3.进一步分析结果2所划分的两组患者间存在的预后差异,我们可以得出以下结论:高危组中患者在总体生存时间上,相较于低危组患者存在显著的降低(P<0.001)。通过ROC曲线进一步分析得出此预后风险标签3年、5年、10年预后可信度的AUC值分别为0.712、0.633和0.720,表明该预测标签在不同时段上预测头颈鳞癌患者预后均具有一定的参考意义。4.单因素及多因素Cox回归分析用于评价由内质网应激显著相关基因所构建的预后风险标签是否独立于临床相关变量,实验结果显示它们的风险评分与患者总体生存时间(Overall Survival,OS)依旧存在显著相关性,进一步提示本实验以内质网应激基因表达谱为切入点所构建的预测标签或可作为头颈部鳞状细胞癌患者的独立预后因子。结论:1.USP14、UFM1、CANX、TOR1A、BCAP31、TRIB3在头颈部鳞状细胞癌高表达,ABCA7和ITPR1在头颈部鳞状细胞癌低表达,且这些表达趋势与头颈鳞状细胞癌不良预后可能相关。2.由USP14、ABCA7、UFM1、CANX、ITPR1、TOR1A、BCAP31、TRIB3组成的预测标签可能作为头颈部鳞状细胞癌患者预后的独立风险标签。