地黄组蛋白乙酰化修饰酶家族蛋白鉴定及在连作障碍形成中的作用分析

来源 :2016首届中国中药资源大会暨CSNR中药及天然药物资源研究专业委员会第十二届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jieyses1023
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  组蛋白乙酰化修饰在基因表达调控中起着重要作用.前期研究发现组蛋白乙酰作用调控了连作障碍毒害基因的表达,本研究在地黄蛋白文库的基础上,利用生物信息学方法精确鉴定地黄组蛋白乙酰化修饰酶蛋白,并详细研究其在连作过程中和不同胁迫下表达模式.在地黄转录组文库中筛选出9个组蛋白乙酰转移酶(Histone acetyltransferases,HATs)、14个组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases,HATs),家族分析表明HATs划分为4个家族,主要有CBP/p300、GNAT、MYST、TFIID;HDACs划分为3类,主要包含HDAC、SIR2和HD2.表达模式分析发现:6个基因在连作显著调表达,17个基因差异不明显;在不同胁迫处理下4个基因显著表达.进一步通过乙酰化修饰酶共表达基因表达分析发现HATs共表达基因参与了RNA降解活动及HDACs共表达基因参与核、核质、RNA、蛋白质运输和刺激响应以及核苷酸、RNA代谢活动.为进一步阐述染色质修饰机制在地黄连作障碍形成中的作用机制奠定基础.
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