感染GCRV的草鱼miRNA测序与比较分析

来源 :水生生物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wavepku
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为探索基于高通量筛选抗性主效miRNA功能分子的方法应用于抗性草鱼(Ctenopharyngodon idellus)的选育,研究借助高通量测序鉴定分析感染GCRV前后的草鱼头肾组织中miRNAs.测序结果共鉴定出821个成熟miRNAs,其中118个在GCRV攻毒组特异表达,82个为未攻毒组特有;差异分析结果显示,GCRV处理后有88个miRNA显著下调表达、46个miRNA显著上调表达;qPCR结果显示miR-21在GCRV感染组中的头肾中表达量最高,miR-194a在两个比较组中的差异倍数最大,达到48倍之高;组织表达结果发现部分差异表达miRNA在脾脏、肾脏、头肾、皮肤和鳃等免疫相关器官中高表达;这些结果提示不同的miRNAs在草鱼的GCRV应答过程中发挥着不同的功能,为抗病草鱼的选育提供可参考的分子资源.
其他文献
针对三维激光点云分类中点特征提取邻域大小选择困难问题,本文基于自适应最优邻域尺寸选择实现三维激光点云精细分类.首先使用局部邻域协方差矩阵特征值得到的线性特征、平面性特征和散射性特征构造局部邻域熵函数,通过局部邻域熵函数取最小值时的最佳邻域尺寸计算点云特征描述参数;基于特征描述参数提取点云特征;最后根据递归特征消除法(RFE)筛选出最优特征子集,采用随机森林算法对特征子集进行分类.利用公开标记的Oakland三维激光点云数据集进行实验,结果表明本文点云分类方法的总体分类精度达94.1%,平均F1分数达到76
为分析黑果枸杞黑白浆果两者体内与花青素合成有关的7个关键结构基因(CHS、CHI、F3\'5\'H、F3H、F3\'H、DFR和ANS)的表达模式,本实验测定了黑白浆果各发育时期(S1~S2)的花青素含量,利用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)技术测定并分析了黑白浆果不同发育时期各部位中花青素合成关键结构基因的表达.结果表明:(1)黑果中:花青素在发育前期开始积累,发育中期含量达到最高且稳步保持至发育后期.S1时期,7个结构基因均低表达;S2~S5时期,转录因子调控下的7个关键结构基因均高表
在高陡危岩治理过程中,可以通过其表面裂缝进行分析得到直观的参考信息.但是高陡危岩数据在很长一段时间难以获取,并且危岩体表面具有复杂的纹理,一直是困扰治理工作者的难题.本文应用无人机获取危岩裂缝图像,提出了一种基于高通滤波器与直方图匹配的危岩裂缝边缘检测方法.首先将无人机获取的RGB图像转化为灰度图像,采用中值滤波消除原图像中的稀疏离散噪声,然后进行傅里叶变换,把灰度图像转入频率域,在频率域中采用Butterworth高通滤波器锐化裂缝边缘信息;用傅里叶逆变换从频率域回到空间域,进行图像二值化,初步检测出裂
为认识南水北调中线干渠异味物质的时空动态,于2018年9月至2019年8月对干渠沿线9个样点开展了6种异味物质、藻类群落及理化因子的逐月同步调查;结果显示:二甲基异莰醇含量平均值为(7.431±9.631)ng/L,夏季略超出嗅阈值;β-环柠檬醛和β-紫罗兰酮平均值分别为(12.371±12.800)和(11.973±20.643)ng/L,β-紫罗兰酮含量在秋季超标;二甲基三硫醚平均值为(173.014±302.047)ng/L,冬季和春季未检出;土臭素和甲硫醚含量全年全程未超出嗅阈值;6种异味物质的季
本文以山东省作为研究区域,采用NPP-VI IRS夜间灯光数据、Landsat-8影像数据与山东省137个县级行政区第二、三产业生产总值数据进行分级空间建模,寻找城市建设用地和第二、三产业生产总值最优拟合方式.试验结果表明,城市灯光亮度值与第二、三产业生产总值具有强相关性.建模结果表明各级数据拟合优度在0.92左右,预测偏差均小于10%,其中绝大部分在5%左右.且通过最优模型进行县级行政区域第二、三产业生产总值预测分析其精度优于未分级的预测精度.这种建模方法可以为衡量城市经济发展程度提供参考.
近年来,天、空、地一体化测绘技术飞速发展,无人机航空摄影测量就是其中的一种,它是传统航空摄影测量手段的有力补充,具有机动灵活、高效快速、精细准确、作业成本低、适用范围广、生产周期短等特点,在小区域和飞行困难地区高分辨率影像快速获取方面具有明显优势.本文旨在探索无人机航空摄影测量技术在地形测图中的应用,以及实现在三维实景模型中提取地形图要素的技术方法,满足大比例尺地形图相关精度要求,形成完整的技术流程体系.
应用统计方法对近10 a青海省决策气象服务产品的主要特征和主要气象灾害的分布特征进行了分析,探讨如何在新形势下改变决策气象服务的方式和手段,提升决策气象服务质量.分析发现:(1)近10a来决策气象服务产品越来越多元化、专业化;(2)决策气象服务产品在“精”不在“多”,对产品的“针对性”和“前瞻性”的要求在不断提高;(3)近几年青海省决策气象服务工作已深度融入防灾减灾救灾全过程中,但在产品的信息含量、应急反应、服务时效性等方面还存在短板;(4)在“智慧化”气象发展的推动下,以防灾减灾为目的,提高决策气象服务
本文认为现行教材[1-6]关于方差、协方差和中误差估式的解释与收敛表达存在不严密之处.应用辛钦大数定律,给出了方差、协方差估式及偶然误差平均值的依概率收敛公式.证明了方差、协方差估式的无偏性和中误差估式的有偏性,给出了方差和中误差估式的精度,推导了中误差的无偏估计及其精度公式.
为实现大型海藻人工移植高效、节约和可持续性,研究基于大型海藻孢子的粘附特性,于2020年4月,初选了几种食品添加剂作为粘附剂,与铜藻(Sargassum horneri)孢子混合后,通过室内外涂覆实验观察孢子附着、萌发和生长情况,筛选出最优的粘附剂,并通过铜藻孢子低温保存实验研究解决延长海藻人工移植周期问题.结果表明:(1)海藻酸钠是一种较好的海藻孢子粘附剂,由其制成的铜藻孢子黏液,黏度越大、数量越多对孢子的保护作用越强,可有效阻碍水流冲刷与稀释的影响,增强孢子的附着几率,铜藻孢子黏液潮下带涂抹实验的孢子
实验研究不同剂量(100、500和1000μL)的解淀粉芽孢杆菌菌液、解淀粉芽孢杆菌代谢产物和解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)及代谢产物混合液3种组合对三角褐指藻(Phaeodactylum tricornutum)生长的影响.结果表明,解淀粉芽孢杆菌、其代谢产物和两种的混合液对三角褐指藻均表现出了抑制作用,添加菌液组在第4天时藻细胞数显著低于对照组(P<0.05),添加代谢产物组在1—4d藻细胞数均显著低于对照组(P<0.05),添加菌液及代谢产物组混合液组在1—4