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胚胎干细胞(embryonic stem cells,ES细胞)特异性分子标志是指ES细胞胞内或胞膜上特异表达的分子。已报道的包括转录因子、信号通路受体、黏附因子在内的ES细胞特异性标志与ES细胞的自我更新和全能性具有密切关系。ES细胞特异性分子标志的研究,有助于ES细胞的鉴定、分离纯化、质量控制,加快ES细胞的基础研究和临床应用。现对目前已经发现的ES细胞特异性分子标志及其研究方法和常用ES细胞分子标志的功能进行综述。