【摘 要】
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目的通过TCGA数据库对肺腺癌（LUAD）病人相关测序资料进行分析,探讨与LUAD预后相关的长链非编码RNA（LncRNAs）。方法从TCGA数据库下载LUAD的基因表达资料及临床信息,使用edge R包进行差异分析,Survival包行预后分析,加权基因共表达网络分析（WGCNA）包构建共表达网络,寻找与生存显著相关的基因模块,ClusterProfiler包对目标模块的mRNA进行基因本体论（
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目（81670822,8137-0990）； 青岛市医疗卫生B类重点学科（青卫科教字[2019]9号）；
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目的通过TCGA数据库对肺腺癌（LUAD）病人相关测序资料进行分析,探讨与LUAD预后相关的长链非编码RNA（LncRNAs）。方法从TCGA数据库下载LUAD的基因表达资料及临床信息,使用edge R包进行差异分析,Survival包行预后分析,加权基因共表达网络分析（WGCNA）包构建共表达网络,寻找与生存显著相关的基因模块,ClusterProfiler包对目标模块的mRNA进行基因本体论（GO）注释和KEGG富集分析。结果共筛选得到15 473个差异表达基因（DEGs）,进一步筛选得到187个差异表达的LncRNAs（DELncRNAs）,其中80个DELncRNAs表达上调,107个DELncRNAs表达下调。将DELncRNAs纳入Cox危险比例回归模型进行分析,得到影响LUAD病人预后的15个LncRNAs。Kaplan Meier分析验证显示,Cox分析结果中低风险的LUAD病人较高风险者拥有更长的生存期。通过WGCNA生成40个模块,其中violet模块与生存相关性最高（r=0.680,P<0.05）;violet模块中的LncRNAs与预后相关的DELncRNAs取交集,通过筛选得到LINC00982。对violet模块的mRNA进行富集分析后显示,LINC00982在血管生成、白细胞介素-6（IL-6）、淋巴免疫等有关的生物学过程（BP）中显著富集,在核染色体等有关的细胞成分（CC）中占比增加,与嘧菌酯域结合等有关的分子功能（MF）有关,主要参与IL-17、PD-L1等相关的信号通路。Pearson分析显示,PRDM16表达水平随LINC00982表达上调而升高（r=0.897,P<0.001）,可能为LINC00982的靶基因。结论 LINC00982可能为预测LUAD病人预后的生物学标志物,通过靶控PRDM16参与LUAD的发生发展。
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