基于癌症基因组图谱数据库探索miR-217在胃癌中的表达及其预后价值

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目的 评估miR-217在胃癌组织中的表达及其预后价值。方法 利用R语言统计学软件下载癌症基因组图谱数据库(TCGA)胃癌数据集中患者的临床病理学资料、生存数据和miRNA测序数据,比较miR-217在肿瘤组织与癌旁组织间的表达差异,受试者操作特征曲线(ROC)评估miR-217对胃癌的诊断价值; Kaplan-Meier生存分析比较不同miR-217表达水平的胃癌患者无进展时间(PFI)和总生存期(OS);利用单因素和多因素Cox回归分析评估影响PFI和OS的预后因子;利用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对miR-217潜在靶基因进行功能和信号通路富集分析。结果 446例胃癌患者纳入分析,Wilcoxon秩和检验结果显示,miR-217显著高表达于胃癌组织(5.10 vs. 3.74,P<0.01)。经ROC曲线评估发现,miR-217具有良好的诊断价值(AUC=0.795,95%CI:0.728~0.863)。Kaplan-Meier结果显示,与低表达组比较,miR-217高表达的患者OS更短(56.2个月vs. 22.3个月,P=0.005),但两组患者PFI之间的差异无统计学意义(55.9个月vs. 26.0个月,P=0.099)。多因素Cox回归分析结果显示,miR-217是影响患者OS的独立预后因子之一(HR=1.386,95%CI:1.003~1.914,P=0.048),但miR-217的表达与患者PFI无明显相关性(P>0.05)。GO/KEGG富集分析结果表明,miR-217潜在的靶基因主要富集于前列腺癌、膀胱癌、黑色素瘤、子宫内膜癌、EGFR酪氨酸激酶抑制剂抵抗、细胞间蛋白转运调节、蛋白入核调节、神经分支形态、成长发育负向调节及核-浆转运调控等病理过程。结论 miR-217显著高表达于胃癌组织,其表达水平可用于预测胃癌患者的死亡风险; miR-217的生物学功能可能与泌尿生殖系统恶性肿瘤以及蛋白质转运等相关。
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