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目的了解四川省县级及县级以上公立医院2003～2007年的药品收入现状,以期对公立医院的改革和补偿机制提供数据支持和参考依据。方法采用文献分析、专家咨询、问卷调查、描述性分析及重复测量资料的两水平模型探讨不同分类医院药品收入占医院总收入比例的差异。结果全省县级及县级以上公立医院的药品收入占医院总收入比例逐年下降;三级医院的药品收入占总收入的比例低于二级医院和其他医院;中药收入占药品收入比例为10.30%;结论2003～2007年,四川省的药品收入占医院总收入的平均比例39.17%低于全国平均水平41.83%;建议政府加大对二级医院和其他级别医院的投入;建议医院通过提高效率、缩短平均住院日、增设药事服务费等方式弥补缺口;加大民族医药在基本药物目录中的比重。