单细胞测序分析喉癌及其微环境代谢相关靶基因

来源 :山东大学耳鼻喉眼学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ananjuben
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目的利用单细胞测序技术寻找喉癌细胞糖酵解和谷氨酰胺代谢相关中小分子靶向药物可能的靶基因。方法利用R语言对既往单细胞测序的结果重分析,对细胞进行TSNE分类,对代谢相关基因在喉癌各细胞亚群中的表达进行分析。结果喉癌细胞糖酵解过程中可能成为小分子代谢药物作用靶点的基因包括:葡萄糖转运蛋白、己糖激酶、丙酮酸激酶;谷氨酰胺分解代谢中可能成为药物作用的靶基因包括:谷氨酰胺转运蛋白、谷氨酰胺酶、谷氨酸脱氢酶1、苹果酸脱氢酶、乳酸脱氢酶、异柠檬酸脱氢酶2。结论喉癌细胞中存在与糖酵解和谷氨酰胺代谢相关的基因靶点,可以作为药物研发的方向。
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