目的：喉癌（laryngeal cancer,LC）是全球最常见的头颈部肿瘤之一，世界范围内的死亡率和发病率都很高。尽管付出了巨大的努力，但人们对喉癌发生恶性进展的机制仍然认识不足。本研究旨在通过深度生物信息学分析，寻找可作为喉癌生物标志物或治疗靶点的关键基因标志物。方法：从美国肿瘤基因组图谱（the Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库中收集117个喉癌患者样本，16 746个喉癌基因RNA测序数据和9个临床特征，采用加权基因共表达网络分析（weighted gene coexpression network analysis,WGCNA）构建多个共表达基因模块。对相关的共表达模块和临床特征进行研究，验证它们之间的相关性，并利用模块之间的关联来探索疾病发生通路中的关键基因，最后运用Kaplan-Meier plotter验证富集后的基因与喉癌预后的相关性。结果：通过WGCNA，共构建出16个喉癌共表达基因模块，并发现其中的4个共表达模块（黄色、洋红、黑色、褐色共表达模块）与3个临床特征（初始病理诊断年龄、癌症状态和病理N分期）有相关性。其中，黄色和洋红基因共表达模块与病理诊断的年龄呈负相关（分别为r=-0.23,P＜0.05;r=-0.33,P＜0.05）；黑色和褐色基因共表达模块与癌症状态呈负相关（分别为r=-0.39,P＜0.05;r=-0.50,P＜0.05）。另外，褐色基因共表达模块与病理N分期呈现显著正相关。基因本体（gene ontology,GO）富集分析鉴定出77条相关通路，京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路富集分析鉴定出30条相关信号通路，包括钙信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、神经活性配体-受体相互作用和脂肪细胞脂肪分解调控等。随后，我们确定了这些模块中的中枢基因。中枢基因与喉癌患者的总生存率显著相关，包括CHRNB4,FOXL2,KCNG1,LOC440173,ADAMTS15,BMP2,FAP和KIAA1644。结论：通过WGCNA和验证，筛选出8个可作为喉癌潜在基因生物标志物的基因，为喉癌的临床诊断、预后和治疗提供参考。