【摘 要】
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目的·采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)探索抑郁症相关的差异基因模块及其枢纽基因,并对差异基因模块进行生物功能注释。方法·在之前对8例抑郁症患者及8名健康对照者(对照组)的外周血mRNA微阵列分析实验的基础上,应用t检验筛选抑郁症患者与对照组的差异表达基因,通过R软件WGCNA包进行分析;当关联系数阈值设定为0.9时,参数β=14,以此构建基因数据集的共表达网络。应用混合动态树切割方法切割网络产生基因模块。采用
【机 构】
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复旦大学附属中山医院心理医学科,上海交通大学医学院附属精神卫生中心精神科,上海市浦东新区南汇精神卫生中心精神科,上海中医药大学中药研究所神经药理实验室,中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心,上海市重
【基金项目】
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国家重点研发计划(2016YFC1307100),国家自然科学基金(81930033,81771465),上海交通大学遗传发育与精神神经疾病教育部重点实验室开放课题(2019GDND02),上海市浦东新区卫生系统重点专科建设资助项目(PWZzk2017-27),上海市卫生和计划生育委员会青年项目(20164Y0209)。
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目的·采用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)探索抑郁症相关的差异基因模块及其枢纽基因,并对差异基因模块进行生物功能注释。方法·在之前对8例抑郁症患者及8名健康对照者(对照组)的外周血mRNA微阵列分析实验的基础上,应用t检验筛选抑郁症患者与对照组的差异表达基因,通过R软件WGCNA包进行分析;当关联系数阈值设定为0.9时,参数β=14,以此构建基因数据集的共表达网络。应用混合动态树切割方法切割网络产生基因模块。采用
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