近年来，我国自然灾害频繁发生，给我国的经济社会发展造成了巨大负面影响。作为灾害应急处理的保障性资源，应急救援物资的配送问题受到了越来越广泛的关注。由于自然灾害处理过程中存在着许多不确定性，在救援物资配送时经常会遇到应急需求点地址变动、需求量变动、配送运力变动、服务时间窗变动等干扰事件。此时，如果系统仍然按照原定的最优配送计划对救援车辆进行调度分派，就会出现部分应急需求点的需求难以被满足的情况。因此，研究如何利用干扰管理的思想和方法去权衡多方利益，快速生成系统扰动最小的优化调整方案，将不确定性因素对配送工作的影响降到最低，对于提高整个自然灾害应急物流配送系统的时效性和稳定性，完善我国自然灾害应急处理机制具有重要意义。本文以突发性自然灾害中救援物资的配送问题为研究内容，针对由道路系统瘫痪、车辆故障、疫情爆发等突发事件造成原配送计划失效的问题，以干扰管理的思想为指导，首先，构建了一个以总物资延误时间最少为目标的初始配送模型。随后，根据自然灾害应急物流的特点对系统扰动进行了分类界定并提出了对应的扰动识别方法。接着，以灾民不满意度、路径偏离度和配送成本三个指标对系统扰动进行量化处理。在此基础上，通过字典序法构建了一个以灾民不满意度偏离最小为一级目标的自然灾害应急物流配送干扰管理系统模型。最后，通过matlab7.0编程实现改进的遗产算法对模型进行了仿真实验，并将实验结果与采用传统的Scheduling和Rescheduling方法获得的调整方案进行对比分析，对本模型在处理自然灾害应急物流系统扰动时的有效性和优越性进行了验证。