背景:胆道闭锁是婴儿期一种特发性胆汁淤积性疾病,患有此病的患者通常会出现肝内、肝外胆管进行性炎症和纤维化。这一疾病会在较短的时间内发展为重症,若不在第一时间内采取干预措施,则患儿常于生后2年内死亡。目前学术界对其致病机制还未达成一致意见,而其早期诊断缺乏有效手段,晚期行葛西（KASAI）手术治疗效果欠佳,最终需要肝移植治疗。然而肝移植也存在一定的局限性,比如费用较高,需终身服用免疫抑制剂,对患儿家庭及社会造成了沉重的负担,故而对BA的研究具有重要的现实意义。目前医学界对BA病因未完全阐明,而以往的研究主要是围绕免疫学展开。此类疾病的形成与众多免疫因素有关,比如Th1细胞过度活化、Th17细胞/Treg细胞比例失衡。经过长期研究,有学者证实肠道微生物可以调节机体Th1、Th17和Treg细胞等免疫细胞。一旦肠道菌群稳态被打破,则可能会引发一系列疾病,比如炎症性肠病（IBD）、类风湿性关节炎（RA）、系统性红斑狼疮（SLE）、白塞氏病（BD）和多发性硬化症（MS）等。现阶段,学术界对BA的流行病学、诊断和治疗等做了较为全面的论述并建立起相应的理论体系,然而BA与人体肠道微生物群之间的相互作用方面的研究较缺乏,因此本次研究可填补这一领域的空白。本研究的第一部分引入了目前比较成熟的16S r RNA基因高通量测序法。收集了符合研究条件的43例BA患者和22例健康对照组资料,采用Illumina-Nova测序方法对其粪便标本进行检测。共获得信息完整的16S r RNA基因V3-V4区序列3150811条,之后将这些序列划分为1034个分类操作单元（OTU）。然后对BA患者组与健康对照组进行了对比分析。总的来说,BA患者肠道菌群的α多样性高于健康对照组。在门水平,BA患者厚壁菌门和变形菌门更为丰富,而健康对照组的放线菌门和拟杆菌门更为丰富。在属水平上,BA患者链球菌、克雷伯菌和嗜血杆菌更为丰富,而双歧杆菌、拟杆菌和乳酸杆菌较健康对照组则有所下降。通过研究表明,胆道闭锁患儿肠道微生物与健康对照组存在显著差异,可能与胆道闭锁患儿肠道胆汁酸的急剧减少及肝脏受损导致蛋白质及消化酶合成障碍有关。本研究的第二部分分析了BA肝移植受者的肠道微生态。共从BA肝移植术前组（n=12）、BA肝移植术后组（n=12）和健康对照组（n=22）收集了46份粪便样本。采用16S r RNA基因高通量测序法,共获得信息完整的16S r RNA基因V3-V4区序列2156108条,之后将这些序列划分为729个分类操作单元（OTU）。分析结果表明,三组样本肠道微生物分属10个门类,包括变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、梭杆菌门、Epsilonbacteraeota、蓝藻菌门、疣微菌门、酸杆菌门和Patescibacteria。其中,变形菌门、放线菌门、拟杆菌门和厚壁菌门占细菌总数的98%。与健康对照组相比,BA肝移植术前患者粪便中放线菌门丰度降低;厚壁菌门丰度明显增加,变形菌门无明显变化。BA肝移植术后患者的与术前相比,厚壁菌门的丰度增加,而放线菌门和拟杆菌门丰度明显减少。BA肝移植术前患者、BA肝移植术后患者与健康对照人群之间的肠道微生物的种群结构及丰度均存在差异。本研究通过对胆道闭锁（BA）患者肠道微生态的研究,初次用Illumina-Nova测序描绘BA患儿肠道微生物的种群结构及丰度,并与健康对照组肠道微生态进行了比较分析,为进一步研究BA患者肠道微生态与宿主免疫功能、物质代谢及疾病的关系提供了重要依据。此外,本研究通过比较BA患者肝移植前后肠道微生态的变化,初步揭示肝移植手术、免疫抑制剂等因素对肠道微生态的影响,为进一步研究提供了重要参考数据。