农村非点源污染己成为影响水体环境质量的重要污染源，对河流水库等水体具有很大的危害。由于农村非点源污染具有随机性、滞后性、不确定性和长期性等特点，因而监控与预测难度较大，相应的研究与控制工作因不被人们所重视而相对滞后，急需相关的技术支撑，因此，农村非点源污染负荷核算具有重要的研究价值。本文的主要研究内容如下：（1）研究农村非点源污染负荷核算通用方法对农业非点源污染负荷估算常用方法进行研究，整合出适合国内资料、技术情况的三类不同资料条件下的农业非点源核算方法，并在介绍各类方法的原理及其特点的基础上，探讨其各自共性技术。同时建立农村生活和散养畜禽非点源污染负荷核算的通用方法。（2）分析典型小流域的非点源污染输出特征选取了潭江流域中的泗合水小流域作为监测小流域，在该小流域出口的双桥水文站开展多场次水量水质同步监测工作，利用监测资料分析小流域非点源污染的产生过程及特征规律。（3）构建研究流域的HSPF水文水质模型利用泗合小流域水量水质同步观测数据，进行HSPF模型参数率定及验证。将所构建的模型应用于潭江流域圣堂断面控制流域，模拟了圣堂断面控制流域各非点源污染物的逐日过程，分析各主要河段各污染物通量结果的空间分布情况。得到潭江流域圣堂断面控制流域各土地利用类型各污染物2010年的年负荷量，分析各土地利用类型对各污染物的贡献率，可看出林地及耕地在各类污染物中的贡献率是最大的。得出2010年不同类型土地利用上的各种污染负荷单位面积产出量，可看出各类负荷单位产出量最高的集中在耕地或建设用地，各类负荷单位产出量最少的为水域或荒地。（4）圣堂及牛湾断面的农村非点源污染负荷量估算分别采用HSPF模型模拟和基于模型下的输出系数法计算得到圣堂断面和牛湾断面控制流域各自2010年的农业非点源负荷量，并利用产汇污系数法和统计资料计算得到各自的农村生活污染负荷和散养畜禽等非点源污染负荷量，将三者相加得到圣堂断面控制流域和牛湾断面控制流域内各自的农村非点源污染入河年负荷量，统计计算各污染源负荷量，可得到各自的流域污染负荷总入河量，并与实测的通量值进行对比，可发现各污染负荷估算的相对误差大多均在30%范围内。