高分子链的性质对其小孔移位影响的研究

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高分子链穿过纳米孔移位的过程不仅常见于许多生命过程,如蛋白质在细胞内的跨膜传输,RNA通过细胞核孔的转移,从病毒向靶细胞注射DNA等;也在生物,医药,化工等方面有着广阔的应用前景,比如基于纳米孔的DNA测序技术越来越方便低廉,生物体内可控的药物输运,胶体电泳,以及基因治疗等。本论文主要利用朗之万动力学模拟和福克-普朗克公式计算两种方法研究了高分子链的性质对其穿过纳米孔的移位动力学的影响。论文研究的主要成果如下:(1)利用双吸收边界条件下的福克-普朗克公式计算了部分带电高分子链通过中性纳米孔的移位时间。对于仅一个链节带电的高分子链,我们发现链的移位时间取决于带电链节的位置和孔内驱动力的大小。当电荷位于穿孔高分子链的前半部分时,其移位时间大于中性高分子链的移位时间,且移位时间随着驱动力的增大而增大;当电荷位于穿孔高分子链的后半部分时,其移位时间小于中性高分子链的移位时间,且移位时间随着驱动力的增大而减小。我们还研究了电荷位置对称分布的带两个同种及异种电荷的高分子链,以及带有两个位置随机分布的电荷的高分子链的移位行为。研究结果都表明,部分带电高分子链的移位时间与电荷位置和驱动力的大小有关。(2)利用朗之万动力学模拟研究了半刚性高分子链的刚性对其穿过纳米孔移位过程的影响。模拟结果表明,由于刚性高分子链比柔性高分子链受到更大的粘滞阻力,因此移位时间随刚性的增加而增加。移位时间与刚性、高分子链长以及驱动力之间的标度关系,都依赖于刚性和链长。从这些标度定律可以看出,当刚性较小且链长较长时(链的回转半径大于链的持久长度),我们可以把半刚性高分子链看作是柔性高分子链;而当刚性较大且链长较短时(链的回转半径小于链的持久长度),我们则可以把半刚性高分子链看作是刚性高分子链。模拟结果还表明,随着刚性的增加,移位过程中的非平衡效应减弱。(3)高分子链的构象性质与温度有关,高分子链在高温处于无规线团状态,而在低温处于紧密球状态。采用朗之万动力学模拟研究了温度对带电高分子链从有排斥相互作用的纳米孔中逃逸的影响。逃逸时间与高分子链长度之间具有<?esp>N2.43?0.05的标度关系,我们发现该标度指数与温度无关。这个标度指数值与高分子链的无驱穿孔移位时间与链长的标度关系相同。而逃逸时间随温度增加以指数形式<?esp>exp(A/T)降低,我们观察到不同的温度依赖行为:在高温(T>TH)条件下A=0.76?0.02,在中温(TL<T<TH)条件下为A=0.18?0.01,在低温(T<TL)条件下为A=0.80?0.02。我们从自由能的角度分析了A在中温区特别小的物理机制。我们还分析了产生这三种温区的原因。我们发现,<?esp>可以表示为逃逸总步数与每步所需时间的乘积,随着温度的降低,每步所需时间在TH急剧增加,然后高分子链逃逸总步数在TL急剧增加。
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