敲除/沉默MUC1对人三阴性乳腺癌细胞增殖与侵袭迁移的影响

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hnfengzhong
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目的:基于Crispr/Cas9基因编辑技术对MUC1基因进行敲除,利用短发夹RNA(sh RNA)技术对MUC1基因表达进行沉默,探究MUC1对人三阴性乳腺癌(TNBC)细胞Hs578T、MDA-MB-231增殖与侵袭迁移的影响,并通过高通量测序,分析敲除MUC1基因后,TNBC细胞转录组改变情况,寻找MUC1可能的作用通路及机制。方法:1.MUC1的表达情况利用GEDS网站与Biogps网站对人正常乳腺组织中MUC1表达情况进行分析。利用TCGA数据库分析乳腺癌及其亚型中MUC1表达水平。2.MUC1基因的敲除与沉默利用Crispr/Cas9基因编辑技术对TNBC细胞(Hs578T、MDA-MB-231)MUC1基因进行敲除,构建578T-MUC1KO细胞株与231-MUC1KO细胞株。利用sh RNA技术对TNBC细胞MUC1基因表达进行沉默,构建578T-sh MUC1细胞株与231-sh MUC1细胞株。Western Blot验证敲除与沉默效果。3.敲除与沉默MUC1对TNBC细胞增殖的影响。通过CCK-8实验与集落形成实验检测敲除与沉默MUC1对TNBC细胞增殖的影响。4.敲除与沉默MUC1对TNBC细胞侵袭迁移的影响。通过Transwell实验检测敲除与沉默MUC1对TNBC细胞侵袭能力的影响,通过划痕实验检测对迁移能力的影响。5.MUC1敲除对Hs578T细胞基因转录组表达情况的影响采用高通量测序,分析Hs578T与578T-MUC1KO细胞株转录组基因表达差异,GO分析与KEGG分析寻找MUC1可能作用通路与调控机制。结果:1.人乳腺导管细胞中MUC1表达水平最高,乳腺间质细胞表达水平最低。人乳腺癌组织中MUC1表达水平显著高于乳腺正常组织。乳腺癌亚型中,Luminal型MUC1表达水平最高,TNBC-LAR(腔面雄激素受体型)次之。2.Western Blot实验证明了Crispr/Cas9敲除MUC1后,Hs578T与MDA-MB-231细胞中MUC1蛋白基本不表达。sh RNA沉默MUC1后,Hs578T与MDA-MB-231细胞中MUC1蛋白表达水平明显下降。3.无论是敲除MUC1还是沉默MUC1,Hs578T与MDA-MB-231细胞的增殖速率和集落形成能力都无明显改变。4.Transwell中,无论是敲除MUC1还是沉默MUC1,都能有效减少Hs578T与MDA-MB-231细胞穿过小室的细胞数量,且差异显著(P<0.05)。划痕实验中,无论是敲除MUC1还是沉默MUC1,都能有效减少Hs578T与MDA-MB-231细胞迁移距离。5.Hs578T与578T-MUC1KO细胞进行转录组高通量测序,578T-MUC1KO细胞与Hs578T细胞对比,一共分析得到差异表达基因1519个,上调基因932个,下调基因587个。对差异基因进行GO富集分析,生物进程主要富集在proteolysis(蛋白质水解)与cell adhesion(细胞黏附)方面,各富集差异基因53个。KEGG富集分析主要富集在PI3K-Akt信号通路与MAPK信号通路,分别富集到43个与30个相关基因。差异表达基因与GSEA CELL MIGRATION数据集overlap发现13个与MUC1相关的侵袭迁移基因。结论:敲除MUC1基因与沉默MUC1基因都能有效抑制Hs578T与MDA-MB-231细胞侵袭迁移能力,但对其增殖能力未见明显影响。MUC1可能通过PI3K-Akt信号通路与MAPK信号通路以及调控DPYSL5、UNC5C、AMOT、GDNF、CX3CL1、ANOS1、SAA1、NEXN、PARP9、CXCL8、PARD6B、ITGB2、VEGFC等基因介导TNBC侵袭迁移。
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