中华蜜蜂(Apis cerana cerana)哺育蜂和采集蜂头部基因表达谱的比较研究

来源 :福建农林大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mmyxj
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
中华蜜蜂在1-18日龄以内时,主要在巢内从事哺育和清理巢房等工作,随着其日龄逐渐增大,在15-18日龄以后,蜜蜂逐渐开始从事采集工作。当蜂群中没有足量的采集蜂时,部分年幼的哺育蜂会提前发育,进而提前进入采集活动当中;而当蜂群中的哺育蜂缺乏时,蜂群中有部分蜜蜂会始终进行哺育工作,最终发育成为超龄哺育蜂。为了研究采集蜂与哺育蜂之间的不依赖于日龄的劳动分工机制,我们对此时哺育蜂和采集蜂的特异性的数字化基因表达谱(DGE)进行了比较研究。首先我们对刚羽化出房的蜜蜂进行标记,并将他们随机放在两个不同的蜂群当中,每个蜂群都有一个已经交配成功的正在产卵的蜂王。其中一个是正常的蜂群,包含正常发育的采集蜂和哺育蜂;另外一个蜂群则全部由这些标记好的幼蜂组成,称之为同龄群,期间我们需要不断的将同龄群巢房中的大幼虫脾拿走,换上只有卵的巢脾。然后从正常的蜂群中收集刚羽化出房的蜜蜂(1日龄,N1EM)、正常的哺育蜂(7日龄,N7BY)和正常的采集蜂(18日龄和22日龄,N18CJ和N22CJ);从同龄群中收集早熟的采集蜂(7日龄,Tq7CJ)和超龄哺育蜂(22 日龄,Tq22BY)。从上述六个样品的头部中分别提取RNA,经过DGE测序,我们得到了这六个样品的数字化基因表达谱,分别编号为N1EM-刚羽化出房的蜜蜂,N7BY-正常的哺育蜂,Tq7CJ-提前发育的采集蜂,N18CJ-正常的采集蜂,N22CJ-正常的采集蜂和Tq22BY-超龄哺育蜂。其clean reads数目对应的数据分别是N1EM中为11459815,N7BY中为13628575,Tq7CJ 中 15344756,N18CJ 中是 10539625,N22CJ 中为 12576088,Tq22BY中为16895454。它们与中华蜜蜂的基因组的匹配率分别是87.06%(N1EM)、84.1%(N7BY)、86.19%(Tq7CJ)、85.2%(N18CJ)、90.65%(N22CJ)和85.15%(Tq22BY)。正常的哺育蜂(N7BY)与正常的采集蜂(N18CJ)相比共有415个有表达差异的基因,其中在正常的采集蜂(N18CJ)中有229个基因下调,186个基因上调。正常哺育蜂(N7BY)与提前发育的采集蜂(Tq7CJ)相比,在正常的哺育蜂(N7BY)的492个有表达差异的基因当中,共有374个基因表达下调,118个基因表达上调。超龄哺育蜂(Tq22BY)与正常的哺育蜂(N7BY)相比,共有263个表达差异的基因存在于超龄哺育蜂(Tq22BY)中,其中表达上调的基因有116个,表达下调的基因有147个。正常的采集蜂(N22CJ)与超龄哺育蜂(Tq22BY)的比较发现,共有228个表达差异的基因,其中正常采集蜂(N22CJ)中表达上调的基因有65个,下调的基因有163个。正常采集蜂(N18CJ和N22CJ)与提前发育的采集蜂(Tq7CJ)相比,共有156个有表达差异的基因。所有的采集蜂(N18CJ、N22CJ和Tq7CJ)与哺育蜂(N7BY和Tq22BY)相比,在这些有表达差异的基因中,169个基因是哺育蜂所特有的,103个基因是采集蜂所特有的。这169个哺育蜂特有基因主要是一些转运蛋白质,它们会在内质网上的蛋白质的加工过程、蛋白质的外排和核糖体三个KEGG通路中富集,而采集蜂所特有的基因主要属于一些磷酸酶、激酶、蛋白质以及一些脂酯类物质的基因,参与了核糖体、代谢途径、内质网上的蛋白质的加工过程通路。通过对蜜蜂头部的数字化基因表达谱进行比较和分析,为解释蜜蜂劳动分工的分子机制打下一定的分子生物学基础。同时,所得的序列信息也极大的丰富了中华蜜蜂的基因组数据库。
其他文献
凝聚态物理至今已经发展了半个多世纪,取得了很多惊人的成果,在生活中也有相当重要的应用。近年来,量子霍尔效应己经拓展到量子自旋霍尔体系、三维拓扑绝缘体、强关联电子体系。在凝聚态物理的研究对象中,强关联多体系统是其重要的模型之一,但是在实验上,其微观性质是很难获得的,所以,很多学者利用人工构建的模型来模拟凝聚态物理中的相关问题,同时在实验方面也取得了巨大的突破。例如,约瑟夫森结和光晶格束缚冷原子实验,
钙钛矿太阳能电池作为第三代薄膜太阳能电池,由于其材料优异的光电转换能力和高的载流子迁移率等优势引起了研究人员的极大关注,在短短十年间,效率由最初的3.8%飞跃至24.2%,
目的:通过对伴有或不伴有慢性牙周炎的冠心病患者的血清中炎性细胞因子的定量检测,比较其水平差异,期望筛选出联系慢性牙周炎与冠心病的关键炎性细胞因子,从而探索两疾病在炎
商业化石墨负极材料理论容量低、倍率性能差,在一定程度上阻碍了锂离子电池的进一步应用。过渡金属化合物具有能量密度高、环境友好、成本低的优点,被认为是下一代锂离子电池
切换系统是一类典型的混杂系统,由于其在现实生活中有着十分广泛的应用,已经成为了控制领域的研究热点,并且涌现出许多优秀的研究成果。但是,在切换系统的实际应用场景下,还
如今,随着计算机技术的快速发展,商用级电脑变得无处不在。无论是在政府机构、军事系统,各类公司还是学校,都有它的身影。随着商用计算机在社会生产活动中的广泛应用,人们的
毛竹(Phyllostachys edulis)是重要的亚热带经济林资源,其具有固定森林土壤有机碳和减少温室气体排放的优势。普通尿素施用会增加土壤温室气体的排放,而生物炭施用对降低土壤
在现实生活中,人们可以很容易地获取大量的数据,但是通常其中大部分数据是没有样本标签的。传统的监督学习算法仅使用少部分有标签的数据进行训练,由于训练样本规模小,信息不
相关向量机(Relevance Vector Machine,RVM)是一种基于稀疏贝叶斯理论的机器学习算法。该算法十分擅长处理小规模数据问题,由于其优秀的表现,已经应用于图像处理、故障诊断等
由于化石燃料的过度使用,导致了能源危机和环境破坏。可充电金属-空气电池和全水裂解已被视为替代化石燃料的绿色能量存储和转换装置。但是,但缓慢的氧还原(ORR)、析氧(OER)和析