农产品增值税政策在实行过程当中一直存在许多问题。2012年7月1日之前，农产品增值税抵扣方法为收购发票在实行过程中，是按照“购买法”抵扣。该办法抵扣增值税计算简捷，容易弄明白，财务人员和税务人员都容易把握和计算，也方便于税务部门核查企业进项税实现情况，但是购买法也有许多的问题，由于企业自行开具手工收购发票时，一些违法企业存在更改开票日期、延期纳税时间、推延缴税月份;不按照实际情况开具购买的数量、金额，从而达到虚抵扣进项税额的目的等等。至此，国税总局和财政部在2012年联合公布了财税[2012]38号。农产品进项税额由凭收购发票扣税法调整为核定扣除法，抵扣方法产生了根本性的转变。为了斟酌与法规的链接及变革的稳当性，考虑先易后难的规则，国税总局和财政部选择植物油加工等三个行业来先行试点。　　笔者在重庆A公司一直从事税务相关工作，试行植物油核定扣除办法计算增值税进项税，一直代表重庆A公司与重庆市渝中区国家税务局工作人员一起研究、沟通、协商核定扣除办法相关事宜。在翻阅相关资料、文献过程当中，发现钻研和探讨粮油加工企业的资料、文献有些少。现在，我国正加速推动粮油加工行业供给侧结构性革新，培养一批具备国际竞争力的大型粮油企业集团，笔者就对粮油加工企业相关优惠税收政策进行深入研究，应用数据分析和案例分析法找出粮油加工企业和重庆A公司核定扣除办法在试行中存在的问题，结合国内和重庆市当地的情况，分析核定扣除进项税额的核算和优化研究。　　本文的研究主要包含五个部分，第一部分主要研究粮油加工企业进项税额管理的背景和意义，农产品核定扣除背景，本文研究内容、研究方法和研究思路，本文的研究创新和主要工作;第二部分为我国粮油加工企业农产品核定扣除办法增值税进项税额研究，先进行相关理论概念研究，再粮油加工企业发展之现状、农产品增值税进项税核定扣除办法政策、农产品增值税进项税核定扣除会计与税务处理、当前农产品增值税进项税核定扣除政策的利弊分析研究;第三部分为重庆A公司增值税进项税核定扣除现状分析，根据第二部分研究内容，实际运用于重庆A公司当中，在根据重庆A公司自身特点，进行背景、重庆市增值税进项税核定管理现状、A公司核定扣除基本情况、案例分析和存在问题进行分析和研究;第四部分，为重庆A公司增值税进项税核定扣除的对策和建议，从公司自身改进和税务政策改进研究;最后一部分，是本文的结论和展望，笔者能力限制，存在一些不完善、不深入的地方，需要更细更深的核定扣除办法政策研究。