科创板是我国资本市场发展史上浓墨重彩的一笔,是我国资本市场改革开放、不断迈向成熟的重要标志。科创板的开板、注册制的实行,意味着市场化的定价方式与更自由的市场,是实现资本市场更好服务于实体经济的必要一环,而这一切建立在价格机制良好有序的前提下。相较于西方成熟资本市场,我国市场各参与方相对来说并不成熟,投机氛围更为浓厚,加诸科创板本身开板未久,对于适用于科创板、行之有效的估值方法的需求逐渐展现。随着我国收入水平、健康意识的不断上升,医药企业具有较大成长空间,尤其是创新药企业在众多行业中脱颖而出,于科创板中占据最大份额,而此类企业往往具有高研发投入、收入不确定性大、企业间可比性较低等特征,传统估值方法应用于其估值问题时存在诸多局限。基于上述原因,本文欲研究探讨一种适用于科创板医药企业的估值方法。在分析了科创板医药企业特征的基础上,本文对传统估值方法的优缺点及适用性进行了归纳总结。并通过将企业价值按来源划分为企业在位资产价值与企业在研资产价值两部分,分别提出其适用的估值模型,构建了一个适用于科创板医药企业估值问题的方法。在此方法中,选择自由现金流折现模型作为在位资产的估值方法,并在营业收入的预测中融入了生命周期视角以及5P模型,基于营业收入的预测合理性得以上升;在在研资产的估值方法选择中,对其进行了实物期权特征分析,认为二叉树模型对该部分价值具有较好的评估效果。在综合评价了模型适用性与局限性的基础上,将模型应用到南新制药的估值中去,对模型应用过程进行了展示。在应用研究过程中,对南新制药在位资产中的帕拉米韦药物管线、仿制药药物管线进行了FCFF(自由现金流折现)估值,对南新制药在研资产中的美他非尼药物管线及美氟尼酮药物管线进行了BT(二叉树)估值。得到最终估值结果为57.09亿元。通过估值结果与市场价值进行比较,以及敏感性分析的手段,对模型的有效性进行了论证。本文的主要结论有:(1)FCFF-BT(自由现金流折现-二叉树)模型较传统估值方法在应用于科创板医药企业估值问题时具有一定优势,且具有有效性;(2)FCFF-BT模型中对企业估值结果有较大影响的因素为研发成功率、在位资产市场份额以及加权平均资本成本。