基于单细胞转录组测序初步探索肿瘤早期浸润γδ T细胞的作用

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目的:通过单细胞转录组测序初步挖掘探讨γδT细胞在肿瘤微环境中的异质性。方法:在8周龄的C57BL/6小鼠中皮下植入B16黑色素瘤,分别对肿瘤形成的早中晚期的肿瘤制备单细胞悬液,通过分选型流式细胞仪分选出纯的γδT细胞,利用单细胞转录组测序技术对其进行分析,深入挖掘关于肿瘤浸润性γδT细胞相比于外周组织的γδT细胞的异质性。结果:在通过对小鼠荷瘤后9天,也就是肿瘤发生早期的时候对γδT细胞进行单细胞转录组测序分析发现,肿瘤内浸润性γδT细胞相比于外周存在异质性,并且通过对cluster1与cluster5亚群进行单独挖掘,发现其高表达杀伤性分子与细胞毒性物质,同时通过本次测序找到了γδT细胞迁入肿瘤内部所需要的趋化因子受体,并发现外周组织没有而在肿瘤组织中存在的γδT细胞亚群。通过对γδT细胞相关的信号通路富集发现,肿瘤内γδT细胞上调JAK-STAT通路以及细胞毒性杀伤相关的通路,而下调MAPK信号通路。进一步对调控γδT细胞功能的转录因子进行分析,发现转录因子Tox对γδT细胞产生IFN-γ的能力起到负调作用,并且Bhlhe40转录因子促进γδT细胞产生IFN-γ。同时m TORC1信号可以负调Tox的表达。结论:通过单细胞转录组测序分别从基因转录水平,信号通路水平,转录因子水平对肿瘤内γδT细胞的异质性进行分析,发现其不管从细胞类型分布,趋化能力,信号通路富集以及转录因子功能上,都与正常组织γδT细胞有较大的差异。
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