感染性疾病是指病毒、细菌、真菌等病原微生物感染人体后所致的疾病，通过接触患者或其分泌物能在人群中互相传播的就是传染性疾病。近年来一些重大的传染性疾病如2003年的SARS疫情、高致病性禽流感，2009年的甲型H1N1流行仍严重地威胁人民群众的身体健康和生命安全，影响我国的社会稳定和经济发展。早期发现和早期诊断传染性疾病是减少传播机会、控制疫情的关键环节。其中实验室对致病菌的早期诊断起着决定性的作用，然而目前对一些重大的感染性疾病仍然缺乏快速有效地诊断方法。microRNA(miRNA)是一类高度保守的、长约22个核苷的内源性单链非编码小分子RNA。miRNA广泛存在于真核生物中，调控转录后的基因表达，在生长、发育、应激反应、病毒感染、癌症、心血管疾病等很多生命过程都起着重要的调控作用。近期研究发现miRNA在感染性疾病的发生、发展上扮演了重要角色。本论文针对几种有重大影响的感染性疾病，从miRNA表达谱角度研究病原微生物对宿主细胞的感染作用，探索宿主miRNA在感染的发生、发展和预后中的作用机制，并开展血清miRNA作为重大感染性疾病快速诊断的应用研究，取得了如下创新性成果:　　 (1)系统研究了病毒感染宿主细胞后的miRNA表达谱变化，并由此分析了病毒与宿主的致病机制，为感染性疾病的诊断和治疗提供新思路。建立了腺病毒3型(AD3)感染人喉癌上皮(Hep2)细胞的感染模型，通过高通量测序(SOLiD)方法检测感染细胞的miRNA表达谱，筛选出44种显著高表达和36种显著低表达的miRNA，进一步通过荧光定量PCR确认了其中14种显著变化的miRNA;通过病毒感染细胞后miRNA的时序性变化揭示了病毒在感染细胞的早期和晚期具有不同的感染机制。　　 (2)miRNA在病毒和宿主的相互关系中起着重要作用，在肠道病毒71型(EV71)病毒感染Hep2细胞的感染模型中，我们通过高通量(SOLiD)测序检测了EV71病毒感染后的细胞miRNA表达谱。研究发现64种miRNA显著升高（2倍以上），基因本体论(GO)分析显示这些miRNA所调控的靶基因多与神经、免疫、细胞死亡等通道有密切关系，而这些都与EV71的致病机制有关，因此miRNA在病毒和宿主的相互关系中起着非常重要的作用，可以为EV71病毒引起感染疾病的诊断和治疗提供新方法。　　 (3)血清miRNA表达谱用于病毒感染性疾病的诊断与分型。通过TaqManLow-DensityArray(TLDA)低密度芯片技术检测了手足口病人的血清miRNA表达谱，筛选出102种显著上调和26种显著下调的miRNA，并对70份病人血清进行qRT-PCR验证。研究结果显示6种血清miRNA(miR-148a,miR-143，miR-324-3p，miR-628-3p，miR-140-5p，miR-362-3p)具有较高的诊断价值，Receiver operating characteristic curve(ROC)操作者接受曲线的AreaUnderCurve(AUC)值在0.828至0.934之间;多元回归分析表明这6种miRNA相结合诊断的特异性达到92.7％，敏感性达到97.1％;研究还发现5种miRNA(miR-148a,miR-143，miR-324-3p，miR-545，miR-140-5p)在EV71和科萨其16型(CVA16)两种亚型的血清中有显著差异，其中miR-545，miR-324-3p，miR-143能够区分这两种手足口的致病病毒亚型。　　 (4)血清miRNA表达谱用于活动型肺结核病的早期诊断。通过TLDA技术检测了肺结核病人的血清miRNA表达谱，获得90种显著上调和7种显著下调的miRNA（变化倍数达到2倍以上），筛选出差异性及特异性大的10种miRNA;并对30份病人及65份正常对照的血清进行验证。研究结果显示7种miRNA(miR-361-5p，miR-889，miR-576-3p，miR-210，miR-26a，miR-432，andmiR-134)的表达有显著差异，其中miR-361-5p，miR-889，andmiR-576-3p显示了较高的诊断价值，ROC曲线的AUC值达到0.71-0.84之间;多元回归分析表明miR-361，miR-889和miR-576-3p相结合有较高的诊断价值，AUC值到达0.863(95％CI0.778-0.947)，可望用于肺结核病的早期诊断。