基于TCGA数据库的肺腺癌自噬基因预后模型建立与应用

来源 :浙江中西医结合杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Akobe
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目的 利用TCGA数据库建立预测肺腺癌(LUAD)预后的自噬基因(ATG)预后模型.方法 通过R(v3.6.1)软件筛选出TCGA数据库中LUAD样本及癌旁样本中差异表达的ATGs,探讨其潜在功能.进一步筛选预后相关的ATGs,计算各样本的风险值(RS)并构建预后模型,探讨RS与生存、临床特征之间的关系.结果 共筛选出9个生存相关ATGs(RAC1、SQSTM1、CD46、NRG3、IKBKB、VMP1、WIPI1、FKBP1B、IKBKB).RS是LUAD患者的独立预后因素(P<0.05),高RS与较短的生存期相关(P<0.05).结论 9个自噬基因构建的自噬预后风险模型,可以用来预测LUAD患者预后情况.
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