目的:本研究拟通过生物信息学技术筛选潜在的乳腺癌诊断及治疗新靶点,并进一步结合肿瘤数据库、临床病理标本及生物实验室研究进一步明确该新靶点在乳腺癌中的表达水平及其临床意义。方法:从GEO综合数据库中下载2张基因芯片,采用GEO2R交互式网络分析工具寻找两张芯片中共同的差异表达基因。进而使用DAVID在线注释工具对DEGs进行功能注释及预测其相关的下游信号通路。采用STRING数据库对DEGs进行PPI网络构建,并使用Cytoscape软件抓取DEGs中的核心模块并采用Cyto Hubba插件、Bingo插件、Kaplan-Meier Plotter数据库选择该基因群中对乳腺癌发生发展过程最具影响的关键基因。对确定的关键基因,采用IHC分析其在临床标本中的表达水平并依据IHC结果及随访信息,绘制目标基因相关的乳腺癌患者生存曲线进一步评价该基因对患者的预后评估价值。通过在生物实验室内采用慢病毒构建目标基因的乳腺癌细胞模型,采用RT-PCR实验和Western Blot实验分析目标基因在乳腺癌细胞系中的表达水平并结合功能学实验评价目标基因差异表达对乳腺癌细胞生物学功能的影响。结果:通过GEO2R分析由GEO数据库中下载的GSE15852和GSE42568两张乳腺癌相关的基因芯片,获得了268个在两个数据集中重叠的DEGs,其中包括73个上调基因和195个下调基因。DAVID在线注释工具分析提示DEGs在细胞增殖负调控、脂质代谢过程、细胞对激素刺激的应答、对药物的应答、蛋白激酶B信号的正调节、转录和DNA模板的正调节、对雌激素应答等生物学过程富集;相关的分子功能的变化主要集中在氧化还原酶活性、肝素结合、核酸结合、转录因子活性和ATP结合上;且DEGs主要影响的细胞组成的变化主要集中在膜筏、细胞表面、侧质膜、双细胞紧密连接、顶端质膜和膜。KEGG通路分析表明DEGs主要富集在PPAR信号通路、AMPK信号通路,细胞外基质与受体的相互作用中和蛋白质的消化和吸收相关的信号通路中。通过STRING数据库构建的PPI网络及Cytoscape软件发现了位于DEGs的核心模块中心位置的DNAJB4基因。通过IHC实验、RT-q PCR实验和Western Blot实验发现DNAJB4基因在乳腺癌组织及乳腺癌细胞系内呈低表达。Transwell小室实验和划痕实验提示,敲减DNAJB4基因后乳腺癌细胞系（MDA-MB-231和MDA-MB-436）的侵袭和迁移能力明显增强。临床患者病理标本IHC检测和生存分析提示DNAJB4低表达的乳腺癌患者的无病生存期和总生存期均较DNAJB4高表达患者的生存期短。结论:本研究由数据库中筛选获得的DNAJB4可能是乳腺癌呈低表达的潜在抑癌基因,而且DNAJB4可能是通过参与抑制乳腺癌细胞的侵袭和迁移过程从而发挥其抑癌的作用。临床研究提示DNAJB4的低表达提示乳腺癌患者的预后不良。因此,深入研究DNAJB4潜在的分子机制可为乳腺癌的临床诊断和治疗提供新的思路和新的靶点。