【摘 要】
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目的:DNA甲基化驱动基因在结直肠癌（colorectal cancer,CRC）发生发展中扮演着重要的角色,但是临床意义不明,亟待研究。本课题旨在探究结直肠癌特异性高表达的DNA甲基化驱动基因,重点研究其生物功能与临床意义;本论文通过分析DNA甲基化驱动基因建立预后风险评估模型并分析了风险模型中患者的药物治疗反应。方法:本篇应用“Methylmix”R包中的算法,对来自癌症基因组图谱（The C
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目的:DNA甲基化驱动基因在结直肠癌（colorectal cancer,CRC）发生发展中扮演着重要的角色,但是临床意义不明,亟待研究。本课题旨在探究结直肠癌特异性高表达的DNA甲基化驱动基因,重点研究其生物功能与临床意义;本论文通过分析DNA甲基化驱动基因建立预后风险评估模型并分析了风险模型中患者的药物治疗反应。方法:本篇应用“Methylmix”R包中的算法,对来自癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库的CRC筛选出DNA甲基化驱动基因,并用“clusterprofiler”R包对甲基化驱动基因进行了GSEA分析。之后依据患者的总生存期（overall survival,OS）,利用COX回归分析构建潜在的预后模型,并将该模型与已发表的模型进行了对比。最后,探究了该模型预测患者药物治疗的潜在性能。结果:1.基于单因素和多因素COX分析,构建了以五个甲基化驱动基因（POU4F1,NOVA1,MAGEA1,SLCO4C1,IZUMO2）为基础的风险评估模型以预测CRC患者的预后。Kaplan-Meier分析和Harrell’s C指数表明,风险评估模型可以明显区分高危组和低危组的患者（对数检验P<0.0001,HR:2.034,95%CI:1.419-2.916,C index:0.655）。ROC（the Receiver Operating Characteristic）评估了该模型的敏感性和特异性,其中训练集AUC值为0.644,验证集AUC值0.819。2.根据风险模型,在高风险组和低风险组之间观察到不同的药物治疗反应,低风险组的完全缓解率为67.2%,高风险组为53%。所以,高危组的患者更可能患有临床进行性疾病。3.组成的风险模型可作为改善临床预后的独立指标且具有为临床治疗提供依据的潜力。结论:本研究借助RNA测序数据与450k甲基化芯片,在结直肠癌中鉴定出181个甲基化驱动基因。同时,根据有效评价指标,筛选出由POU4F1,NOVA1,MAGEA1,SLCO4C1,IZUMO2所组成的模型,可对病人预后和临床治疗提供技术支持。
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目的:头颈部鳞状细胞癌（Head and neck squamous cell cancer,HNSCC）是世界范围内常见的癌症,由于大多数患者无临床前期病史,诊断发现时均表现为晚期HNSCC,预后较差。因此,运用生物信息学去研究其生物标志物对HNSCC来说具有重要意义。以往研究中多数针对单基因做肿瘤标志物,在应用上具有较大局限性。本文主要挖掘出关于HNSCC灵敏度和特异性较高的预后风险联合标志物
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目的:恶性肿瘤是人体内正常的细胞发生了基因突变现象,从而引发了恶性增殖,在发生早期并没有十分明显的症状,不易被察觉发现,等患者出现特异性症状时,已经发展为晚期,因此患者死亡率极高。近些年随着对免疫联合治疗的了解和研讨,肿瘤的免疫治疗方法为肿瘤患者的救治提供了新的思路,其中细胞过继免疫治疗更是有效治疗癌症的途径之一,由细胞因子诱导的杀伤细胞（CIK,cytokine-induced killer）是
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