LncRNA-cCSC1调控结直肠癌细胞增殖的作用及机制研究

来源 :重庆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fxlilac
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:探讨lncRNA-cCSC1调控结直肠癌细胞增殖的作用及其机制。方法:利用TCGA与GEPIA数据库分析结直肠癌患者中lncRNA-cCSC1的表达水平。对比正常的结肠上皮细胞(NCM460),在常用的结直肠癌细胞株(SW480、SW620、HT29、HCT116)中测定lncRNA-cCSC1的表达水平,筛选表达量相对高的两个细胞株,并构建慢病毒稳转株,分为敲低组(sh-cCSC1)及敲低空载组(sh-Control)、过表达组(oe-cCSC1)及过表达空载组(oe-Control)。用miR-124-3p模拟物(mimics)和抑制剂(inhibitor)分别构建miR-124-3p的过表达和敲低水平,mimics空载(mimics NC)和inhibitor空载(inhibitor NC)分别作为相应的对照组。运用DIANA TOOLS和star Base2.0数据库进行生物信息学分析筛选lncRNA-cCSC1调控的下游分子miRNA,并用star Base2.0数据库分析miRNA调控的靶基因。双荧光素酶报告基因实验(luciferase reporter assay)验证lncRNA-cCSC1与下游分子miR-124-3p的结合、miR-124-3p与CD44的结合及它们之间的竞争性内源RNA(ceRNA)机制。进一步通过拯救实验,将oe-cCSC1与mimics或mimics NC共转染、sh-cCSC1与inhibitor或inhibitor NC共转染,探讨lncRNA-cCSC1的下游分子miR-124-3p在结直肠癌细胞增殖中的作用及miR-124-3p作用下对lncRNA-cCSC1调控CD44的影响。CCK-8、克隆形成、流式细胞术和EdU实验检测lncRNA-cCSC1调控结直肠癌细胞增殖的生物学功能。RT-PCR测定目的基因表达情况。Western Blot测定增殖有关蛋白CDK2、Cyclin D1、CDK4和Cyclin E1以及蛋白CD44的表达情况。结果:(1)通过GEPIA和TCGA数据库分析结果显示,lncRNA-cCSC1在结直肠癌组织中显著上调(P<0.05)。同时,RT-PCR结果显示人类结直肠癌细胞株中lncRNA-cCSC1的表达水平较NCM460细胞明显增高,且HCT116和HT29表达量相对较高。我们首先在结直肠癌细胞HCT116和HT29中过表达和敲低lncRNA-cCSC1,用RT-PCR检测转染效率,结果显示:与oe-Control组相比,oe-cCSC1组lncRNA-cCSC1的表达水平显著升高(P<0.01);与sh-Control组相比,sh-cCSC1组lncRNA-cCSC1的表达量显著下降(P<0.01)。同时,上述检测lncRNA-cCSC1调控结直肠癌细胞增殖的生物学功能实验,结果发现:在HCT116和HT29细胞中,与oe-Control组相比,oe-cCSC1组的CCK-8实验结果发现细胞增殖活力明显上升(P<0.05);细胞克隆形成能力得到增强(P<0.01);EdU实验检测细胞增殖显示oe-cCSC1组EdU阳性细胞的比例明显增多(P<0.01);细胞周期发现oe-cCSC1组G1期细胞占比明显降低,S期细胞占比相对增加(P<0.05);Western Blot结果显示oe-cCSC1组增殖相关蛋白CDK2、CDK4、Cyclin D1和Cyclin E1表达上调(P<0.01)。与上述相反的是,与sh-Control组相比,sh-cCSC1组的CCK-8实验结果显示细胞增殖活力减慢(P<0.05);细胞周期结果提示sh-cCSC1组G1期细胞占比明显增多,S期细胞占比相对减少(P<0.05);细胞克隆形成能力相对下降(P<0.01);EdU实验显示EdU阳性细胞的比例大大降低(P<0.01);Western Blot结果表明sh-cCSC1组细胞增殖相关蛋白CDK2、CDK4、Cyclin D1和Cyclin E1蛋白的表达减少(P<0.01)。(2)通过使用DIANA TOOLS以及star Base2.0数据库对lncRNA-cCSC1与CD44共同作用的miRNA进行预测,取得交集后发现lncRNA-cCSC1调控的下游miRNA共有5个,分别为miR-124-3p、miR-506-3p、miR-2114-3p、miR-450b-5p、miR-4766-5p。RT-PCR检测各miRNA的表达量,结果显示在HCT116和HT29细胞系中敲低lncRNA-cCSC1后,miR-124-3p表达水平均增加(P<0.01)。随后,经双荧光素酶实验和RT-PCR进一步验证,发现miR-124-3p是lncRNA-cCSC1的下游分子。同时,双荧光素酶实验还发现miR-124-3p与下游靶基因CD44的结合及lncRNA-cCSC1通过吸附miR-124-3p释放靶基因CD44的作用。RT-PCR结果显示:与sh-Control相比,sh-cCSC1组miR-124-3p的表达量升高,CD44表达降低;与oe-Control组相比,oe-cCSC1时miR-124-3p的表达量降低,CD44表达升高(P<0.01)。采用miR-124-3p的抑制剂和模拟物共表达处理后,与sh-cCSC1+inhibitor NC组相比,sh-cCSC1+inhibitor组miR-124-3p的表达量降低,CD44表达升高;与oe-cCSC1+mimics NC组相比,oe-cCSC1+mimics组miR-124-3p的表达量升高,CD44表达降低(P<0.01)。此外,lncRNA-cCSC1调控结直肠癌细胞增殖受miR-124-3p的影响,相关结果显示:与oe-cCSC1+mimics NC组相比,oe-cCSC1+mimics组CCK-8结果表明细胞增殖活力降低(P<0.05);EdU实验显示EdU阳性细胞的比例大大降低(P<0.01);Western Blot结果显示,加入miR-124-3p mimics显著逆转了oe-cCSC1对CDK2、CDK4、Cyclin D1、Cyclin E1增殖相关蛋白及靶基因CD44蛋白的促进作用(P<0.01)。而与sh-cCSC1+inhibitor NC组相比,sh-cCSC1+inhibitor组则产生相反的作用,即加入miR-124-3p抑制剂逆转了lncRNA-cCSC1敲低对结直肠癌细胞增殖的抑制作用。结论:本研究结果提示,lncRNA-cCSC1可能是通过海绵结合miR-124-3p和上调CD44从而促进结直肠癌细胞的增殖。
其他文献
前列腺癌是发生在前列腺的上皮性恶性肿瘤,是男性泌尿生殖系统发病率较高的恶性肿瘤之一。前列腺癌全球每年新发病例约130万,死亡人数约为35万,是继肺癌之后全球男性恶性肿瘤的第二大病因,是肿瘤特异性死亡的第五大病因。它早期可以表现为无症状,只有在组织学检查时才能诊断。在美国,30%的50岁以上以及60-70%的80岁以上男性可能检测出前列腺癌灶。在我国前列腺癌的发病率约为1/10万。此外,由于大约80
研究背景伏格特-小柳原田综合征(VKH)是一种罕见的自身免疫性疾病,该病以双眼弥漫性葡萄膜炎合并眼外的头痛、耳鸣、听力减退、白斑、脱发、白发和颈部僵硬等症状为主要的临床表现。已有少量的基因被报道在VKH患者的外周血单个核细胞(PBMC)中出现异常的mRNA表达,但是目前尚无VKH患者PBMC的mRNA转录组表达谱数据。目的采用mRNA测序的方法,对VKH患者治疗前和治疗后以及健康人的PBMC进行测
背景中枢神经系统最常见的恶性肿瘤是胶质瘤,约占颅内肿瘤的40%~50%,胶质母细胞瘤是发病率最高的原发恶性中枢神经系统肿瘤,其突出特点是高侵袭和易复发等特性。胶质瘤在神经外科领域一直属于难治性疾病,尽管多年来针对胶质母细胞瘤的临床治疗策略进行了很多研究和改进,包括手术、化疗、放疗以及靶向治疗等,但患者的预后并没有显著改善,总体的中位生存期约14个月,存活超过2年的不足10%。进一步阐明胶质瘤,尤其
目的:研究PRDX2对结直肠癌细胞增殖的影响,阐明PRDX2和p53蛋白的关系,同时揭示PRDX2在p53蛋白转录后修饰的作用及其具体机制。方法:通过生物信息学方法及在线数据库的方式分析PRDX2在结直肠癌和癌旁组织中的表达差异。慢病毒转染结肠癌HCT116及LoVo细胞,将实验所用细胞分为NC和shPRDX2两组。用CCK-8,细胞周期,克隆形成实验检测PRDX2对结直肠癌细胞体外增殖的影响。W
细胞骨架(Cytoskeleton)是细胞内蛋白纤维网络结构,在维持细胞基本形态及内部结构稳定中具有关键作用,同时与胞内多种重要生命活动密切相关。肌动蛋白微丝骨架(F-actin)是三类细胞骨架系统之一,其聚合、解聚及排列呈现高度动态变化。胞浆微丝骨架系统通过LINC复合物与核骨架(核纤层)紧密偶联,调控细胞核结构稳定、染色质结构重塑及基因表达等过程,在细胞正常生理或病理过程中扮演重要角色。已有研
胃癌是世界范围内常见的恶性肿瘤,每年的新发病例和死亡病例数目均位居前列。尽管随着诊疗技术的不断提高以及早期筛查得到一定的重视,胃癌患者的发病率和死亡率有着一定程度的下降,但是进展期胃癌患者预后仍未得到显著改善,术后五年生存率仍处于较低水平。因此,积极探讨胃癌发生发展中的分子机制,挖掘胃癌早期诊断和治疗的靶点对于改善胃癌诊疗的临床现状将有着重要的意义。环状RNA(circular RNA,circR
第一部分IGJ在乳腺癌侵袭和转移中的作用及机制研究背景:转移是导致乳腺癌患者死亡的首要原因,探索乳腺癌转移的机制对改善乳腺癌患者的预后尤为重要。本研究旨在探索IGJ在乳腺癌侵袭和转移中的作用及机制。方法:分析TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中发生转移和未发生转移的乳腺癌患者的差异基因表达谱,筛选出有显著表达差异以及预后价值的目标基因IGJ。利用q-PCR验证IGJ在
目的根据最新的Cancer Statistics报道,在女性中,乳腺癌的发病率排名第一,死亡率排名第二。虽然乳腺癌患者5年生存率随着乳腺癌筛查的普及有所提升;但是现今针对复发及转移乳腺癌患者仍缺乏有效的治疗手段。抑癌基因在乳腺癌的发生发展中发挥重要作用,寻找新的抑癌基因并进一步深入研究其分子机制,将有助于为预后的预测和综合治疗提供新的生物标志物。肿瘤中,抑癌基因常位于染色体杂合性缺失区域(Loss
背景及目的大肠癌是世界重大公共健康问题,发病率居高不下。虽然目前已有手术、化疗、靶向治疗等方法,但治疗效果有限,大肠癌的死亡率仍然排名靠前,因此寻求新的治疗靶点迫在眉睫。随着研究进展,大肠癌表观遗传学改变受到关注。单ADP核糖基化是表观遗传的一种,但在大肠癌中的修饰水平及修饰靶蛋白尚不明确。本研究小组前期研究表明,催化单ADP核糖基化修饰催化酶ARTD8和ARTD14在大肠癌中表达较对照大肠组织显
第一部分儿童尘螨过敏性哮喘患者登记研究数据库的构建研究背景:哮喘是一种异质性疾病,因其不同的临床特征(表型)及病理生理机制(内表型)产生了对药物不同的治疗反应。尘螨过敏性哮喘是儿童最常见的哮喘类型。与随机对照试验(Randomized controlled trial,RCT)相比,患者登记研究(Patient registry study,PRS)能更全面地反映哮喘患儿的真实身体状况、临床诊断和