随着我国农业供给侧结构调整不断推进,国家出台了在南方大力发展推广农作物间、套作的文件。其中,玉米大豆带状复合种植模式在南方、西北及黄淮海等地得到大面积示范推广,既增加土地利用率,又可提高作物产量和经济效益,优势突出,前景看好。但在该种植模式下,低位作物大豆由于受到玉米遮荫导致茎秆发育不良,容易发生倒伏,严重制约着大豆稳产高产。目前,生产上适宜间套作的大豆品种较少,亟需选育适应间套作弱光环境,茎秆抗荫蔽能力强的大豆品种。因此,了解大豆茎秆相关性状对荫蔽响应的遗传规律和效应可加速适宜间套作大豆新品种的培育进程,提升育种效率。本研究选用耐荫较强的大豆品种南豆12和耐荫较弱的九月黄为亲本构建的200份重组自交系为研究材料,以净作为对照,设置玉米大豆带状套作,利用已构建好的SNP高密度遗传连锁图谱,应用QTL IciMapping 4.1软件中的完备区间作图法,对大豆茎秆相关性状(株高、下胚轴长、平均节间长、主茎节数和茎粗)进行QTL分析,主要研究结果如下:1.通过连续三年净套作比较分析发现,在四个时间点,5个茎秆相关性状在净作和套作下差异均达到极显著差异。在玉米大豆共生期,荫蔽导致大豆株高、下胚轴、节间长伸长,茎粗、节数减少,后期玉米收获复光后,大豆得到补偿生长,但同净作相比差异依然明显。2.利用构建好的SNP高密度遗传图谱,采用QTL Icimapping对三年净套作下不同生长时期的茎秆相关性状进行QTL分析。总共检测到139个QTL,分布在1-20号染色体,其中,在净作下检测到90个,可解释表型变异的2.26%-32.12%,表型贡献率超过10%的有34个;在套作下检测到49个,可解释表型变异的1.27%-25.64%,表型变异贡献率超过10%的有22个。3.在不同年份、不同生长时期检测到控制同一性状的QTL有4个;在同一种植模式下总共检测到3个QTL基因簇,控制多个性状;在净作下,控制株高的3个QTLs与控制节间长的QTL定位在相同区段,累计贡献率为18.23%。