大豆芽菜是大豆种子在人工控制适宜的温度和水分条件下,经过萌芽生长而成的一种芽苗蔬菜,是我国的传统优质蔬菜,有着悠久的生产和食用历史。大豆芽菜相关性状多由多基因控制的数量性状,对这些数量性状进行定位,不仅能了解这些数量性状的遗传规律,所定位的数量性状位点(QTL)也能作为基因克隆的基础和分子标记辅助选择的依据。本研究选用大豆微核心种质为研究材料,进行了2年的重复实验。在对该群体大豆芽菜鲜产量、干产量、芽长、根长、成芽率和百粒重6个性状的表型变异分析基础上,利用138个SSR标记对这6个性状进行关联定位分析。主要结果如下：1.大豆芽菜鲜产量、干产量、芽长、根长、成芽率和百粒重6个性状的变异范围十分广泛,品种间差异达极显著水平,适于进行关联分析。相关分析表明,大豆芽菜鲜产量与其他5个性状显著相关,初步筛选出14份鲜产量较高的材料。2.138个SSR标记在243份大豆材料中共检测出752个等位变异,每个标记检测出2-16个等位变异,平均5.45个。每个位点的多态性信息量(PIC)变化为0.204-0.864,平均为0.569,其中引物Sat074位点的PIC最大为0.864,引物Satt405位点的PIC最小为0.204。3.在20个连锁群上138个SSR位点的9453种两两位点组合中,不论共线性组合,还是非共线性组合,都有一定程度连锁不平衡(LD)存在。不平衡程度D>0.5的组合数较少,仅占总位点组合的0.18%,得到统计概率(P<0.01)支持的不平衡成对位点占总位点组合的12.01%。在此基础上选取57个没有明显LD的标记,使用Structure2.2软件进行群体结构分析,将243份材料分为2个亚群,以此作为群体校正的协变量进行关联分析。P<0.05且两年均能检测到的位点一共有28个,其中有9个位点同时与两个性状相关,1个位点与三个性状相关。4.对P<0.01且两年均能检测到的11个标记位点进行优异等位变异发掘。从8个与百粒重相关的标记位点中筛选出6个优异等位变异,2个与大豆芽菜鲜产量相关标记位点中筛选出3个优异等位变异,1个与芽长相关标记位点中筛选出2个优异等位变异,1个与成芽率相关的标记位点中筛选出1个优异等位变异。