【摘 要】
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目的:建立逆转录重组酶介导扩增技术(Reverse Transcription Recombinase-aid Amplification Assay,RT-RAA)分别对柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CVA10)以及柯萨奇病毒A6型(cox
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目的:建立逆转录重组酶介导扩增技术(Reverse Transcription Recombinase-aid Amplification Assay,RT-RAA)分别对柯萨奇病毒A10型(coxsackievirus A10,CVA10)以及柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CVA6)进行简便有效的检测,扩增产物采用荧光法和侧流层析试纸条法两种检测方法。 方法:通过对目的基因进行序列比对,找出其保守序列,根据重组酶介导扩增技术(Recombinase-aid AmplificationAssay,RAA)引物探针的设计原则在其保守序列设计引物探针。根据荧光法和侧流层析试纸条法不同的要求分别对设计好的引物探针进行不同的修饰而建立荧光法逆转录重组酶介导扩增技术(Real-time Reverse Transcription Recombinase-aid Amplification Assay,Real-time RT-RAA)和侧流层析试纸条法逆转录重组酶介导扩增技术(Reverse Transcription Recombinase-aid Amplification Assay Lateral Flow Dipstick,RT-RAA-LFD)。 对建立的方法分别进行灵敏度、特异度评估。收集2016年~2017年河北、山东、湖南三个地区不同医院的455例手足口病患儿的粪便样本,提取核酸,使用建立的方法进行检测,同时采用荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)方法作为参照实验,实验结果通过 SPSS21.0 统计软件进行统计分析。 结果: 1. 荧光法RT-RAA检测柯萨奇病毒A10型结果 荧光法RT-RAA检测柯萨奇病毒A10的灵敏度为35 copy /μl,特异度为100%。以RT-qPCR为参照方法进行临床样本检测,两种方法的Kappa值为0.920(P<0.001)。 2. 荧光法RT-RAA检测柯萨奇病毒A6型结果 荧光法RT-RAA检测柯萨奇病毒A6的灵敏度为38 copy /μl,特异度为100%。以RT-qPCR为参照方法进行临床样本检测,两种方法的Kappa值为0.952(P<0.001)。 3. 侧流层析试纸条法RT-RAA检测柯萨奇病毒A10型结果 侧流层析试纸条法RT-RAA检测柯萨奇病毒A10的灵敏度为38 copy/μl,特异度为100%。以 RT-qPCR 为参照方法进行临床样本检测,两种方法的Kappa值为0.948(P<0.001)。 4. 侧流层析试纸条法RT-RAA检测柯萨奇病毒A6型结果 侧流层析试纸条法RT-RAA检测柯萨奇病毒A6的灵敏度为38 copy/μl,特异度为100%。以 RT-qPCR 为参照方法进行临床样本检测,两种方法的Kappa值为0.952(P<0.001)。 结论:RT-RAA对CVA10和CVA6具有良好的诊断检测能力,非常适合开展床旁检测和现场检测,在对CVA10和CVA6的检测、监控等方面有重要作用。而荧光法和侧流层析试纸条法为RT-RAA提供了不同的结果判读方法,可根据不同的条件做出更合理的选择。
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